A inauguração oficial do encontro entre as duas ferrovias se deu em 8 de julho de 1877, com festas. Porém, tanto a São Paulo Railway, quanto a Estrada de Ferro D. Pedro II utilizavam bitola larga (1,60m), o que exigia baldeação de composições para poder seguir até Santos ou até o Rio de Janeiro.
Em 1889, com a queda do Império, a Estrada de Ferro Dom Pedro II passou a se chamar Estrada de Ferro Central do Brasil.
Na década de 1890, o alto custo das baldeações fez com que em 1896, a E. F. Central do Brasil comprasse e incorporasse a já falida E. F. do Norte, com o propósito de alargar a bitola e unificar as duas linhas no chamado Ramal de São Paulo. O primeiro trecho entre Cachoeira e Taubaté ficou pronto em 1901 e o trecho todo em 1908.
A cidade de Aparecida até hoje é popularmente chamada "Aparecida do Norte", em razão da construção da E.F. do Norte, já que a ferrovia que levava os romeiros ao santuário de Nossa Senhora de Aparecida era a "do Norte".[4]