Pada 18 Mac, tiga kes pertama negara itu disahkan, selepas seorang warganegara pulang dari Arab Saudi menurut kementerian kesihatan negara itu, sebelum kes pertama dilaporkan, Kyrgyzstan menutup sempadannya kepada warga asing. Kyrgyzstan, bersama jirannya, Tajikistan, Kazakhstan dan Uzbekistan, juga telah mengambil langkah untuk mengehadkan atau melarang perhimpunan awam yang besar, serta mengharamkan solat Jumaat di masjid. Kementerian kesihatan juga mengesahkan bahawa tiga pembawa COVID-19 kini dalam kuarantin. Pada hari yang sama, Perdana Menteri Kyrgyzstan memutuskan bahawa topeng perubatan yang diimport dan dieksport dari Kyrgyzstan akan dikecualikan daripada cukai nilai tambah.[5]
Pada 20 Mac, tiga kes baru dilaporkan di Daerah Nookat, Wilayah Osh di Kyrgyzstan selatan. Mereka yang dijangkiti juga baru sahaja kembali dari ziarah ke Arab Saudi. Keadaan darurat diumumkan di daerah tersebut.[6]
Kerajaan mengisytiharkan darurat selama sebulan bermula 22 Mac. Pada hari yang sama, semua pengangkutan awam berhenti beroperasi di Bishkek, kecuali bas elektrik, sebagai langkah prasyarat yang bertujuan untuk membendung penularan virus di ibu negara.[7]
Pada 24 Mac, kerajaan mengeluarkan dekri mengisytiharkan darurat dari 25 Mac hingga 15 April di tiga bandar utama Bishkek, Osh dan Jalal-Abad, sementara keadaan darurat setempat dinyatakan di tiga wilayah. Di Bishkek, perintah berkurung dilaksanakan dari 20:00 hingga 07:00 waktu tempatan, dan pusat pemeriksaan di jalan raya di dalam dan luar bandar.[8]