כְּלֵי נגינה הם חפצים המשמשים להפקת מוזיקה. כל כְּלִי שניתן להפיק באמצעותו צלילים יכול להחשב כְּלִי נגינה, אבל המונח מתייחס רק לחפצים אשר זוהי מטרתם העיקרית.

המקצוע האקדמי אשר עוסק בחקר כלי הנגינה נקרא אורגנולוגיה.

כלי נגינה המפיקים צליל בתגובה לניעור, הכאה או הקשה. אלה נחלקים לשתי קבוצות:

• • ממברנופוניים
    • תופים
    • מרימבה
    • קלימבה
    • ויברפון
    • הרמוניקת זכוכית
    • סטיל דראם
    • קחון
    • ג'מבאליה
    • גלוקנשפיל
    • קסילופון
    • דרבוקה
    • דג'מבה
    • משולש
    • מטלופון
    • תיבה סינית
    • מעגל לשוניות
    • גביע עץ
    • תוף מרים
    • ראקט
    • טאבלה (או "דומבק")
  • אידיופוניים
    • מצלתיים
    • גונג
    • פעמון
    • מסור מוזיקלי

כלי מקלדת בעלי מיתרים:

• פסנתר
• צ'מבלו
• וירג'ינל
• קלאוויקורד
• ספינט
• אורגנית
• אורגן
• ויולה אורגניסטה

כלי מקלדת בעלי מפוח:

• עוגב
• הרמוניום
• אקורדיון

כלי מקלדת אלקטרונים:

• אורגן חשמלי
• פסנתר אלקטרוני
• סינתיסייזר
• מקלדת אלקטרונית

כלי מקלדת-הקשה:

• צ'לסטה

כלי נגינה המפיקים צליל בתגובה לפריטה או קישות על מיתריהם.

• שמיסן
• בגלמה
• סאז
• לאוטה עתיקה
• מנדולינה, מנדולה
• עוד
• בוזוקי
• בללייקה
• ג'ומבוש
• דומרה
• צ'רנגו
• בנג'ו
• תאורבה
• סטאר
• סיטאר
• ציתר
• קוואטרו
• קאנון
• סנטור
• סרוד
• נבל
• גיטרות:
  • גיטרה אקוסטית
  • גיטרה בס
  • גיטרה חשמלית
  • גיטרה קלאסית
  • יוקללה
  • גיטרת פלדה (הוואית)
• כלי קשת:
  • מורין חור
  • לירה
  • כינור
  • ויולה
  • ויולה דה גמבה
  • צ'לו
  • קונטרבס
  • אוקטובס
  • קמנג'ה
  • ארהו
  • קמנצ'ה
  • רבאב

כלי נגינה המפיקים צליל בתגובה לנשיפה לתוכם: האוויר העובר דרכם יוצר בהם ויברציה המתבטאת כצליל.

• כלי נשיפה ממתכת
  • חצוצרה
  • טרומבון
  • בריטון
  • טובה
  • קרן יער
  • קרן האלפים
  • סוזאפון
  • הליקון
  • דידג'רידו
• כלי נשיפה מעץ
  • זורנה
  • בנסורי
  • טרברסו
  • נאי
  • חליל אירי
  • קאוולה
  • חליל אף
  • חליל צד
  • חלילית
  • קרומהורן
  • חליל פאן
  • אבוב
  • בסון
  • קונטרבסון
  • קלרינט
  • סקסופון
  • דודוק
  • אוקרינה
  • פיקולו

כלי נשיפה ביולוגי (טבעי)

• • מיתרי הקול

כלי נגינה המפיקים צליל בתגובה לדחיפת אוויר ממפוח למערכת צינורות.

• • מפוחית
  • אקורדיון
  • חמת חלילים

כלים עם מנגנון אלקטרוני (ולא מכני) המפיק צליל. המחשב עשוי להיחשב כלי נגינה אלקטרוני.

• • דוגם צלילים (סמפלר)

• כלי נגינה במקרא

• עדו אברבאיה, כלי הנגינה, רעננה: האוניברסיטה הפתוחה, 2007.
• ההיסטוריה של כלי הנגינה – או, דו-קרב בסי מז'ור, רן לוי בתוכנית עושים היסטוריה.

מיזמי קרן ויקימדיה
ערך מילוני בוויקימילון: כלי נגינה
תמונות ומדיה בוויקישיתוף: כלי נגינה

• הספרייה הווירטואלית למוזיקה: כלי נגינה, הספרייה למוזיקה של מכללת לוינסקי לחינוך
• רן לוי, דו-קרב בסי-מז'ור – על הטכנולוגיה של כלי נגינה, באתר "עושים היסטוריה" (שידור של הפודקאסט וטקסט מלא שלו)
• סוגי כלי נגינה - אתניים קדומים ומודרניים.
• כלי נגינה, באתר אנציקלופדיה בריטניקה (באנגלית)
• איתמר קרבל, כלי נגינה ממוחשבים, באתר הארץ, 5 במאי 2008
• כלי נגינה, דף שער בספרייה הלאומית

כלי נגינה מרכזיים במוזיקה המזרחית
כלי נשיפה	נאי • בנסורי • זורנה
כלי פריטה בעלי צוואר	עוד • סאז • טאר • בגלמה • בוזוקי • ג'ומבוש
כלי פריטה ללא צוואר	קאנון • סנטור
כלי קשת	קמנג'ה • קמנצ'ה • רבאב
כלי הקשה	דף • דרבוקה • תוף מרים • טאבלה