La ligne Tsukuba Express a d'abord été conçue pour doubler et désengorger la ligne Jōban de la JR East. Sous le nom de « Nouvelle ligne Jōban », elle devait relier la gare de Tokyo à celle de Moriya. Mais à la suite de difficultés économiques, le projet a été modifié. Le terminus dans Tokyo a été déplacé plus au nord, à la gare d'Akihabara. Par contre la ligne a été étendue jusqu'à Tsukuba, à la suite des pressions du gouvernement de la préfecture d'Ibaraki[1]. Le projet a alors pris le nom de Tsukuba Express[2].
Les travaux de construction ont commencé en 1992. La ligne a ouvert le .
La ligne Tsukuba Express est parcourue par 3 modèles de trains : les TX-1000 qui fonctionnent uniquement sous courant continu et par conséquent limités à la section Akihabara-Moriya, et les TX-2000 et TX-3000 bicourants qui parcourent l'ensemble de la ligne.
TX-1000
TX-2000
TX-3000
Fréquentation
En 2010, la fréquentation de la ligne était en moyenne de 283 000 voyageurs par jour. À son ouverture en 2005, la fréquentation était de 151 000 voyageurs par jour[4].