Η Γ΄ Εθνική Κατηγορία περιόδου 2000–2001, γνωστή και ως Δεύτερη Κατηγορία, διεξήχθη με τη συμμετοχή 18 ομάδων που σχημάτισαν έναν όμιλο. Την περίοδο αυτή η διοργανώτρια αρχή είχε μετονομάσει το πρωτάθλημα της Γ΄ Εθνικής Κατηγορίας σε Β΄ Κατηγορία, και αντίστοιχα είχε ονομάσει σε Ανώτερη Κατηγορία το πρωτάθλημα της Α΄ Εθνικής Κατηγορίας και σε Α΄ Κατηγορία το πρωτάθλημα της Β΄ Εθνικής Κατηγορίας. Οι ονομασίες αυτές διατηρήθηκαν μόνο για τη συγκεκριμένη αγωνιστική περίοδο και από της επόμενη επανήλθαν οι παλαιότερες ονομασίες.
Στους αγώνες μπαράζ για την άνοδο συμμετείχαν οι ομάδες που κατέλαβαν τις θέσεις 2 έως 4 του πρωταθλήματος, οι οποίες ήταν η Χαλκηδόνα, ο Ατρόμητος και ο Εθνικός. Το απόλυτο πλεονέκτημα είχε εξασφαλίσει η Χαλκηδόνα η οποία αναδείχθηκε νικήτρια της διαδικασίας με δύο άνετες νίκες απέναντι στους αντιπάλους της.[4]
Οι αγώνες μπαράζ για τον υποβιβασμό πραγματοποιήθηκαν μεταξύ των ομάδων που είχαν καταλάβει τις θέσεις 8 και 9 της βαθμολογίας οι οποίες ήταν ο Απόλλων Κρύας Βρύσης και ο Αχαρναϊκός. Νικητής της διαδικασίας αναδείχθηκε ο Απόλλων Κρύας Βρύσης που πέτυχε στις καθυστερήσεις του τελευταίου αγώνα, το κρίσιμο γκολ που τον κράτησε στην κατηγορία,
[5]