Das Erzbistum Dubuque wurde am 28. Juli 1837 aus dem Bistum Saint Louis herausgetrennt und als eigenständiges Bistum begründet. Dem Erzbistum Baltimore als Suffragandiözese unterstehend, ging es am 20. Juli 1847 in die Kirchenprovinz des nun zum Erzbistum erhobenen Saint Louis über. Am 19. Juli 1850 gab es gemeinsam mit Saint Louis einige Gebiete zur Errichtung des Bistums Saint Paul ab. Nachdem es am 14. Juni 1881 noch einmal einige Gebiete zu Gründung des Bistums Davenport abgegeben hatte, wurde es am 15. Juni 1893 selbst zum Erzbistum mit Metropolitansitz erhoben. Am 15. Januar 1902 trat das Erzbistum Gebiete zur Gründung eines neuen Bistums (Sioux City) ab.