Její otec byl uherským palatinem a ona strávila velkou část svého dětství na Budínském hradě v Uhrách. Její otec zemřel, když jí bylo deset letech a Marie Jindřiška byla odeslána na výchovu do Vídně, kde se v Palais Augarten stala svěřenkyní arcivévody Jana Rakouského. Říkalo se, že ji matka vychovávala „jako chlapce“. Marie Jindřiška byla živá a energická osoba se silnou vůlí a žhavým temperamentem, byla velkou milovnicí koní, hudby a zahradničení. Politický vliv neměla.
V roce 1865 se stala belgickou královnou. Manželství s Leopoldem II. však bylo velmi nešťastné. Marie Jindřiška byla později zatrpklá i vůči svým třem dcerám a synovi. Dcera Štěpánka se později stala manželkou následníka rakousko-uherského trůnu Rudolfa. Po smrti jejich jediného syna Leopolda v roce 1869 se manželé ještě pokusili o zplození dalšího syna, narodila se jim však dcera Klementina. Poté již žili definitivně odděleně a královna se odebrala do Spa, kde také zemřela.
Manželství a potomstvo
Její sňatek s Leopoldem II. se uskutečnil 22. srpna1853. Jednalo se o politický svazek uzavřený za účelem posílení statusu belgického království: protestantský belgický král si přál oženit svého syna s členkou prestižní katolické dynastie. Sňatek byl domluven proti vůli Marie Jindřišky i Leopolda a kvůli jejich odlišnosti bylo nešťastné. Z manželství se narodily čtyři děti, tři dcery a syn
Po roce 1872 žili manželé oddělené životy, i když se nadále objevovali společně na veřejnosti. Královna Marie Jindřiška byla popisována jako energická a inteligentní žena a jezdkyně, oddaná především svým zvířatům. V roce 1895 se otevřeně stáhla z veřejného života a posledních sedm let prožila ve městě Spa, kde se stala známou jako „královna lázní“.
Luisa (18. února 1858 – 1. března 1924), ⚭ 1875 Filip Sasko-Kobursko-Gothajský (28. března 1844 – 3. července 1921), sasko-kobursko-gothajský princ a pán z Čabradi a Sitna
Leopold (12. června 1859 – 22. ledna 1869); vévoda z Brabantu, hrabě z Henegavska
*sasko-kobursko-gothajské princezny sňatkem do roku 1826 **sňatkem také belgická princezna ***sňatkem také britská princezna ^neměla od narození královský ani šlechtický titul