艰难拟梭菌 [ 1] 學名 ：Clostridioides difficile 艰难类梭菌 [ 2] 艰难梭菌 [ 3] Clostridium difficile ）、困難梭狀芽孢桿菌 [ 4] 困難梭狀桿菌 [ 5] [ 6] 拟梭菌属 细菌，一般寄生在人 的肠道 内。厌氧性细菌是指那些在无氧 条件下要比在有氧环境下生长好的细菌，而人的肠道正好是一个相对无氧的环境。如果过度服用某些抗生素 ，艰难拟梭菌的菌群生长速度加快，影响肠道中其他细菌，引发炎症 。
艰难拟梭菌是梭菌属的一个成员，对氧十分敏感，很难分离培养，故得名。梭菌属成员很多，可分为几个群，其中有几个成员对人是致病性的。最著名的有产气荚膜梭菌 、破伤风梭菌 和肉毒梭菌 。产气荚膜梭菌可引起伤口气性坏疽、食物中毒、肌肉坏死、梭菌蜂窝织炎等，破伤风梭菌可引起破伤风 ，肉毒梭菌可引起肉毒中毒。肉毒中毒的典型临床特征是急性弛缓麻痹，先从双侧颅神经阻碍开始，包括面部、头颅和咽部的肌肉，然后对称性下降，包括喉部和肢体肌肉。由于舌或咽部肌瘫痪可引起的呼吸困难，隔膜和肋部的瘫痪可能引起死亡。产气荚膜梭菌是一种常见的引起食物中毒的细菌。
艰难拟梭菌发现于1935年，但直到1977年发现本菌与临床长期使用某些抗生素（氨苄青霉素 、头孢霉素 、红霉素 、氯林可霉素 等）引起的伪膜性结肠炎 有关，方被重视。
艰难拟梭菌广泛分布于自然環境中，如土壤、干草、沙、一些大型动物（牛、驴和马）的粪便 ，及狗、猫、啮齿动物和人的粪便，除此之外还大量存在于水和动物的肠道中。婴儿 的粪便中常含有艰难拟梭菌，为新生婴儿肠道中正常菌群，大约50% 12月龄婴儿的肠道中有艰难拟梭菌，2岁以上儿童的带菌率大约为3%，但此菌在健康成人中出现频率较低，无症状带菌的成人在瑞典是1.9%，在日本为15.4%，這種細菌會產生腸毒素 和細胞毒素 [ 7] 厭氧 梭菌屬 细菌[ 8] 腹瀉 。
主要為 toxin A（TcdA）、toxin B（TcdB）[ 9] [ 10] 尿苷二磷酸葡萄糖 (UDP-glucose）的葡萄糖轉移至 Rho small GTPase（醣基化）使其失活，這將導致：
肌動蛋白 解聚化（actin depolymerization），破壞細胞骨架 完整性，因而出現細胞病變 (變圓)，並導致由caspase -3、9介導的細胞凋亡。活化TLR -4、5，促大量發炎細胞激素 (IL-1β、IL-12、IL-18、TNF-α )產生，導致嚴重的腸道發炎。 以上帶來的結果使腸道上皮細胞大量死亡、上皮緊密連接被破壞，使腸道通透性增加並導致腹瀉 。[ 11]
艰难拟梭菌可定植於人體腸道而不出現症狀，因為腸道正常菌叢 可壓制其生長，但當使用大量廣譜抗生素(如頭孢菌素 )，會殺死正常菌叢，使艰难拟梭菌大量增生並產生毒素，導致腹瀉、噁心、發燒，甚至導致偽膜性結腸炎 及毒性巨結腸症(Toxic megacolon)致死。
通常使用甲硝唑 、萬古黴素 治療，近期發現以糞便微生物移植 作為治療手段有更好的效果且更少的副作用[ 12]
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