芽孢桿菌門
Bacillus subtilis, Gram stained
科学分类
域：	细菌域 Bacteria
演化支：	大地菌 Terrabacteria
门：	芽孢桿菌門 Bacillota
纲
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芽孢桿菌門（Bacillota）旧名厚壁菌門（Firmicutes）^[1]，是一大類細菌，多數爲革蘭氏陽性，有細胞壁的結構^[2]。少數，如柔膜菌綱（Mollicutes）（如支原體），缺乏細胞壁而不能被革蘭氏方法染色，但也和其餘的革蘭氏陽性菌一樣缺乏第二層細胞膜。芽孢桿菌門這個詞原本包括所有革蘭氏陽性菌，但目前僅包括低G+C含量的革蘭氏陽性菌，而高G+C含量的則被劃入放線菌門（Actinobacteria）。芽孢桿菌門表現為球狀或者桿狀。

很多芽孢桿菌可以產生内生孢子，它可以抵抗脫水和極端環境。很多環境中都可找到内生孢子，很多著名的病原菌都能產生孢子。有一類芽孢桿菌，太陽桿菌科可以通過光合作用產生能量。

芽孢桿菌門原來分為三個綱：厭氧的梭菌綱、兼性或者專性好氧的芽孢桿菌綱，和沒有細胞壁的柔膜菌綱。在系統發育樹上前兩類顯示出並系群或者複系群的特徵^[3]。因此它們的分類有待進一步研究，例如柔膜菌綱，有研究認為應該放在另外一個門^[4][5]，但也有其他研究認為應該留在這個門^[6][7]。

以下為本門當中比較著名的屬及其所屬的綱目：

• 芽孢桿菌綱（Bacilli）
  • 芽孢桿菌目（Bacillales）
    • 芽孢桿菌屬（Bacillus）
    • 李斯特氏菌屬（Listeria）
    • 葡萄球菌科（Staphylococcaceae）
      • 葡萄球菌屬（Staphylococcus）
  • 乳桿菌目（Lactobacillales）
    • 腸球菌屬（Enterococcus）
    • 乳桿菌屬（Lactobacillus）
    • 乳球菌屬（Lactococcus）
    • 明串珠菌屬（Leuconostoc）
    • 鏈球菌屬（Streptococcus）
• 梭菌綱（Clostridia）
  • 梭菌目（Clostridiales）
    • 梭菌屬（Clostridium）
    • 優桿菌屬（Eubacterium）
    • 太陽桿菌屬（Heliobacterium）
  • Halanaerobiales
  • Natranaerobiales
  • Thermoanaerobacterales
• 丹毒絲菌綱（Erysipelotrichia）
  • 丹毒絲菌目（Erysipelotrichales）
    • 丹毒絲菌屬（Erysipelothrix）
• Negativicutes
  • Selenomonadales
    • 香蕉孢菌属（Sporomusa）
• Thermolithobacteria
  • Thermolithobacterales
• 柔膜菌綱（Mollicutes）
  • 支原體目（Mycoplasmatales）
    • 支原體屬（Mycoplasma）
    • 螺原體屬(Spiroplasma)
    • 脲原體屬(Ureaplasma)

• 細菌分類表#芽孢桿菌門(Bacillota)
• 革蘭氏陽性菌

• Phylum "Firmicutes" - J.P. Euzéby: List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature