福州市行政區劃和隸屬關係在歷史上有多次變更。
明洪武前期福州府治和闽县治、侯官县治、懷安縣治都在福州城区,懷安縣治以晉代子城的內河與福州府城的北段城牆為界。直到明萬曆後期懷安縣被侯官縣合併。到清時期福州府治和闽县治、侯官县治都在福州城区。当时的福州城区,城内以南大街为界,东半城属闽县,西半城属侯官县;城外南台以东属闽县,以西属侯官县。城内宣政街至还珠门(鼓楼前至东街口)、还珠门至南门兜(通称南街)两段街道(今八一七北路)为闽县、侯官县合治。清末闽县、侯官县都设区治理:闽县分治城内区、南台区和下渡区。城内区又分为:北段(华林坊、钱塘巷一带)、中段(鼓楼前一带)、南段(南大街一带)、东段(东街、旗汛口、法海寺一带)、旗界段(东门大街、汤门大街、河西街、河东街一带)五段。城内井楼门、汤门、东门、水部门、南门五城门均属闽县城内区管辖。南台区分南台、水部两段。下渡区以藤山(仓前山)为首段,泛船浦以下为第二段,江边一带为第三段。侯官县分治城内区、浦东浦西区(南台)和上渡区。城内区分为:东段(宦贵巷一带)、西段(西门大街一带)、北段(府直街、北大街一带)、中段(总督口、小龙湫一带)、南段(南大街、杨桥巷、南后街、光禄坊一带)五段。
現時福州市下轄有6區,6縣,1縣級市,分別是:
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