Мохаммад Хасан Ахунд народився в Пашмулі, район Панджваї, провінція Кандагар.
У період з 1996 по 2001 рік, коли Ісламський Емірат Афганістан фактично контролював більшу частину території Афганістану, Мохаммад Хасан Ахунд обіймав посади міністра закордонних справ і заступника прем'єр-міністра на території, контрольованій талібами. Також обіймав посаду губернатора міста Кандагар.
7 вересня 2021 року «Талібан» оголосив склад тимчасового уряду Афганістану. Виконуючим обов'язки прем'єр-міністра був призначений Мохаммад Хасан Ахунд[4][5][6].