Народився 19 березня1956 року в Москві. Його батько, Тимур Гайдар, — міжнародний військовий кореспондент«Правди», контр-адмірал, — син відомого радянського письменника Аркадія Гайдара від його першої дружини Лії Лазарівни Соломянської. Мати — Аріадна Павлівна Бажова, дочка письменника Павла Бажова. Таким чином, Єгор Гайдар був онуком двох відомих радянських письменників.
Впродовж 1978–1980 років навчався в аспірантурі МГУ під керівництвом академіка Станіслава Шаталіна, захистив кандидатську дисертацію з економічних наук. Тема дисертації: «Оцінночні показники в механізмі господарського розрахунку виробничих об'єднань (підприємств)». Вступив в КПРС
1987–1990 — завідувач відділом економічної політики в журналі ЦК КПРС «Комуніст».
1990 року завідує відділом економіки газети «Правда», захистив докторську дисертацію «Економічні реформи і ієрархічні структури», очолив Інститут економічної політики Академії народного господарства і АН СРСР.
1990–1991 — директор Інституту економічної політики Академії народного господарства СРСР.
З 6 листопада 1991 року[6] до 2 березня1992 року — заступник Голови Уряду Російською Федерації з питань економічної політики.
З 19 лютого 1992 року[8] до 2 квітня 1992 року[9] — міністр фінансів Російської Федерації.
З 2 березня 1992 року[10] до 15 грудня 1992 року[11] — перший заступник Голови Уряду Російської Федерації.
З 15 червня[12] до 15 грудня 1992 року[11] — виконувач обов'язків Голови Уряду Російської Федерації.
1992–1993 і з 1994 до 16 грудня 2009 року — директор Інституту економіки перехідного періоду.
З 18 вересня1993[13] до 20 січня1994 року[14] — перший заступник Голови Ради Міністрів — Уряду Російської Федерації (з 25 грудня 1993 року — Уряду Російської Федерації).
З 22 вересня 1993 року[15] до 20 січня 1994 року[14] — виконувач обов'язків міністра економіки Російської Федерації.
З грудня 1993 року до грудня 1995 року — депутат Державної думи Росії, з січня 1994 року — голова депутатської фракції «Вибір Росії».
16 грудня2009 року о 4 годині ранку Єгор Гайдар помер у своєму заміському будинку в Підмосков'ї. За інформацією російських ЗМІ причиною смерті став набряк легенів, викликаний ішемією міокарда.