Бактериофа́ги, или фа́ги (от др.-греч.φᾰ́γω — «пожираю»), — вирусы, заражающие бактериальные клетки. Ранее бактериофагами называли и вирусы архей, однако в настоящее время этот термин принято относить исключительно к бактериальным вирусам. Бактериофаги, как и любые иные вирусы, размножаются внутри клетки хозяина. Высвобождение потомства большинства бактериофагов происходит путём лизиса инфицированной бактериальной клетки, однако при размножении бактериофагов некоторых групп, например, нитчатых фагов, выход вирусных частиц происходит без разрушения клетки, которая сохраняет свою жизнеспособность. Вирусная частица или вирион бактериофага состоит из оболочки, как правило белковой, и генетического материала — одноцепочечной или двуцепочечной нуклеиновой кислоты (ДНК или, реже, РНК). Общая численность бактериофагов в большинстве природных местообитаний примерно равна численности бактерий или превышает ее в 2—10 раз, при этом общее количество фаговых частиц в биосфере Земли составляет 1030—1032 частиц[1]. Бактериофаги активно участвуют в круговороте химических веществ и энергии, оказывают заметное влияние на состав, динамику и активность микробных сообществ, влияют на эволюцию микробов, на их взаимодействия между собой и с многоклеточными организмами и даже участвуют в контроле экспрессии собственных генов микроорганизмов[1][2]. У бактерий существует также большое число генетических элементов и кодируемых ими молекулярных структур, имеющих общее происхождение с бактериофагами, «приспособленных» микробами для тех или иных собственных нужд: дефектные профаги, бактериоцины типов R и F, AFP-профаги (от англ. antifeeding prophage — профаги, препятствующие питанию), системы секреции VI типа (T6SS), сократимые системы, ассоциированные с метаморфозом (MAC), агенты переноса генов (GTA — gene tranfer agents) и другие[2]. Бактериофаги, а также антивирусные (противофаговые) системы бактерий послужили источником большей части инструментария современной генетической инженерии и ряда других технологий[2].
К концу XIX столетия микробиология была достаточно развитой наукой, в которой активно работало значительное число исследователей, а также практических специалистов-бактериологов, занятых в клинике и на некоторых производствах. Более того, к началу XX века вирусы (по тогдашней терминологии фильтрующиеся вирусы) уже были известны: в 1892 году Дмитрием Ивановским был открыт вирус табачной мозаики, а в 1898 году Фридрихом Лёфлером и Паулем Фрошем был описан вирус ящура. С высокой долей вероятности многие исследователи встречались с явлением бактериофагии. Известно несколько десятков статей, вышедших до 1915 года, которые сообщают об эффектах, сходных с бактериофагией[3], среди которых можно упомянуть работу Н. Ф. Гамалеи, наблюдавшего в 1897 году явление лизиса бактерий (сибиреязвенной палочки) под влиянием перевиваемого агента[3][4]. В 1915 году английский микробиолог Фредерик Туорт описал так называемое стекловидное перерождение колоний стафилококков, возбудитель которого проходил через фарфоровые бактериальные фильтры, и его можно было переносить от одной колонии к другой. Туорт охарактеризовал этот агент как вирус, заражающий бактерии и даже выдвинул предположение о возможном эволюционном происхождении вирусов из доклеточных форм жизни[4][5].
Независимо от Фредерика Туорта франко-канадский микробиолог Феликс д’Эрелль сообщил в 1917 году об открытии вируса возбудителя дизентерии, который он назвал бактериофагом[4][6]. Важнейшим достижением д’Эрелля была верная интерпретация стерильных пятен (бляшек), образующихся в сплошном слое бактериального роста на плотной среде (так называемом газоне) под действием разбавленной суспензии фага как индивидуальных негативных колоний бактериофага. Д’Эрелль сделал верное заключение, что в большинстве случаев бляшка формируется из отдельной фаговой частицы, что приводило, во-первых, к заключению о корпускулярной природе фага (в противоположность гипотезе о растворимом токсине, имеющем минимальную действующую концентрацию), а во-вторых дало возможность практического измерения концентрации активных фаговых частиц (или, точнее, бляшкообразующих единиц) в суспензиях. Возможность простой визуализации фагов и определения их концентрации методом посева сыграла ключевую роль в дальнейших исследованиях природы бактериофагов.
После открытия явлений бактериофагии д’Эрелль развил учение о том, что бактериофаги, обитающие в кишечнике человека и животных, способны адаптироваться к размножению на патогенных бактериях, и играют ключевую роль в естественном иммунитете, обеспечивая выздоровление больного организма даже в большей степени, чем известные в то время клеточные и гуморальные факторы иммунитета[4][7][8]. Это положение привлекло к напряженному научному противостоянию д’Эрелля и его сторонников с Жюлем Борде и его школой, которые пытались доказать, что бактериофагия не является результатом действия специфического паразита, но возникает в результате внутреннего «физиологического дисбаланса» бактерий[4][8]. Это противостояние хотя и привлекло к проблеме бактериофагии внимание ряда ученых, несколько задержало широкое признание взглядов д’Эрелля на бактериофаг как на ультрамикроскопический организм. Окончательно эти споры были разрешены только благодаря применению электронного микроскопа, которое в начале 1940-х позволило напрямую наблюдать вирионы бактериофагов[4].
Тем не менее, уже в 1922 году немецкий генетик Герман Мёллер, опираясь на результаты д’Эрелля и сотрудника Ж. Борде Андре Грациа сделал предположение, что «тельца д’Эрелля» (бактериофаги) представляют собой гены, способные к передаче (выражаясь современным языком, предположил, что бактериофаги являются трансмиссивной генетической программой), что, по мнению Мёллера, позволяло «атаковать проблему гена под совершенно новым углом» и давало надежду, что генетики скоро смогут «растирать гены в ступке или запекать в печи»[4][9].
В 1940-х — в начале 1950-х годов в результате работ так называемой фаговой группы, неформальным лидером который был Макс Дельбрюк, а также группы Джошуа Ледерберга и ряда других исследовательских коллективов, данная гипотеза была полностью подтверждена. В 1930—1950-е годы многие исследователи работали также над раскрытием механизмов лизогении, которая была впервые описана д’Эреллем и Борде, которые, однако, не смогли верно интерпретировать свои наблюдения. Окончательно проблема была разрешена в результате работ групп Андре Львова во Франции и Д. Ледерберга. Ими было показано, что профаг — генетический материал умеренного бактериофага — содержится в каждой лизогенной клетке, но проявляется лишь в некоторых в процессе так называемой индукции. Более того, удалось продемонстрировать, что профаги не просто присутствуют в клетке, но интегрируются в её собственный генетический аппарат — хромосому[4][10]. Эти работы (в сочетании с развивавшимися в то же время исследованиями по генетике бактерий) заложили основы молекулярной генетики и молекулярной биологии и привели к созданию современной концепции вируса как трансмиссивной генетической программы, а также концепции провируса — временно «спящей» формы некоторых вирусов, интегрированной в клеточный геном.
Помимо своих пионерских исследований, касающихся природы бактериофага, Ф. д’Эрелль также предложил вводить полученный in vitro бактериофаг в качестве средства лечения бактериальных инфекций[4][7]. Этот подход известен как фаговая терапия. По сообщениям самого д’Эрелля в его руках метод фаговой терапии характеризовался впечатляющей эффективностью[7], и в 1920—1930-е годы эта технология была крайне популярна на Западе, а также в СССР. Однако нестабильные результаты лечения бактериофагами, а также появление сульфаниламидных препаратов и антибиотиков привели практически к исчезновению интереса к фаговой терапии в западной медицине[4][11]. В СССР (а после распада страны — в России и Грузии) этот метод продолжал применяться. В 2010—2020-х годах фаговая терапия вновь рассматривается как перспективный метод борьбы с бактериальными инфекциями, потенциально способный сгладить последствия глобального кризиса, вызванного распространением устойчивости к антибиотикам[12][13].
Бактериофаги различаются по химической структуре, типу нуклеиновой кислоты, морфологии и характеру взаимодействия с бактериями. По размеру фаги в сотни и тысячи раз меньше микробных клеток.
Типичная фаговая частица (вирион) состоит из головки и хвоста. Длина хвоста обычно в 2—4 раза больше диаметра головки. В головке содержится генетический материал — одноцепочечная или двуцепочечная РНК или ДНК с ферментомтранскриптазой в неактивном состоянии, окружённая белковой или липопротеиновой оболочкой — капсидом, сохраняющим геном вне клетки[14].
Нуклеиновая кислота и капсид вместе составляют нуклеокапсид. Бактериофаги могут иметь икосаэдральный капсид, собранный из множества копий одного или двух специфичных белков. Обычно углы состоят из пентамеров белка, а опора каждой стороны из гексамеров того же или сходного белка. Более того, фаги по форме могут быть сферические, лимоновидные или плеоморфные[15].
Хвост, или отросток, представляет собой белковую трубку — продолжение белковой оболочки головки, в основании хвоста имеется АТФаза, которая регенерирует энергию для инъекции генетического материала. Существуют также бактериофаги с коротким отростком, не имеющие отростка и нитевидные[16].
Головка округлой, гексагональной или палочковидной формы диаметром 45—140 нм. Отросток толщиной 10—40 и длиной 100—200 нм. Одни из бактериофагов округлы, другие нитевидны, размером 8×800 нм. Длина нити нуклеиновой кислоты во много раз превышает размер головки, в которой находится в скрученном состоянии, и достигает 60—70 мкм. Отросток имеет вид полой трубки, окружённой чехлом, содержащим сократительные белки, подобные мышечным. У ряда вирусов чехол способен сокращаться, обнажая часть стержня. На конце отростка у многих бактериофагов имеется базальная пластинка, от которой отходят тонкие длинные нити, способствующие прикреплению фага к бактерии. Общее количество белка в частице фага — 50—60 %, нуклеиновых кислот — 40—50 %[17].
Фаги, как и все вирусы, являются внутриклеточными паразитами, и не способны к самостоятельному размножению. Хотя они содержат всю информацию для запуска собственной репродукции в соответствующем хозяине, у них нет механизмов для выработки энергии и рибосом для синтеза белка. Размер известных фаговых геномов варьирует от нескольких тысяч до 498 тысяч пар оснований (геном фага G, поражающего бацилл)[18][19]. В метагеномных исследованиях описывали фаговые геномы длиной до 735 т. п. о.[20].
Классификация бактериофагов
Информация в этом разделе устарела.
Вы можете помочь проекту, обновив её и убрав после этого данный шаблон.
Большое количество выделенных и изученных бактериофагов определяет необходимость их систематизации. Этим занимается Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). В настоящее время, согласно Международной классификации и номенклатуре вирусов, бактериофаги разделяют в зависимости от типа нуклеиновой кислоты и морфологии.
На данный момент выделяют девятнадцать семейств. Из них только два РНК-содержащих и только пять семейств имеют оболочку. Из семейств ДНК-содержащих вирусов только два семейства имеют одноцепочечные геномы. У девяти ДНК-содержащих семейств геном представлен кольцевой ДНК, а у других девяти — линейной. В 2000 году считалось, что девять семейств специфичны только для бактерий, остальные девять только для архей, а представители семейства Tectiviridae инфицируют как бактерий, так и архей[21].
Классификация вирусов бактерий и архей по ICTV[22]
Адсорбция бактериофагов на поверхности бактериальной клетки
По характеру взаимодействия бактериофага с бактериальной клеткой различают вирулентные и умеренные фаги[16].
Вирулентные фаги могут увеличиваться в количестве только посредством литического цикла[23]. Умеренные бактериофаги после деления клетки находятся в состоянии профага (лизогенный цикл).
Начальные этапы взаимодействия с бактериальной клеткой одинаковы для умеренных и вирулентных бактериофагов. Бактериофаги прикрепляются к фагоспецифическим рецепторам на поверхности бактериальной клетки. Хвост фага с помощью ферментов, находящихся на его конце (в основном лизоцима), локально растворяет оболочку клетки, сокращается и содержащаяся в головке ДНК инъецируется в клетку, при этом белковая оболочка бактериофага остаётся снаружи.
При инициации литического цикла инъецированная ДНК вызывает полную перестройку метаболизма клетки: прекращается синтез бактериальной ДНК, РНК и белков. Нуклеиновая кислота фага реплицируется. Репликация ДНК бактериофага происходит по полуконсервативному механизму и осуществляется с участием собственных ДНК-полимераз. ДНК бактериофага начинает транскрибироваться с помощью собственного фермента транскриптазы, который после попадания в бактериальную клетку активируется. Синтезируются сначала ранние, а затем поздние мРНК, которые поступают на рибосомы клетки-хозяина, где синтезируются, соответственно, ранние (ДНК-полимеразы, нуклеазы) и поздние белки бактериофага (белки капсида и хвостового отростка, ферменты лизоцим, АТФаза и транскриптаза). После синтеза поздних белков и завершения репликации ДНК наступает заключительный процесс — созревание фаговых частиц или соединение фаговой ДНК с белком оболочки и образование зрелых инфекционных фаговых частиц[24]. Продолжительность этого процесса может составлять от нескольких минут до нескольких часов[23]. Затем происходит лизис клетки, и освобождаются новые зрелые бактериофаги[16].
При инициации лизогенного цикла генетический материал фага обратимо взаимодействует с генетической системой клетки-хозяина, интегрируясь в хромосому или сохраняясь в виде плазмиды[23]. Таким образом, вирусный геном реплицируется синхронно с ДНК хозяина и делением клетки, а бактериофаг в подобном состоянии называется профагом. Бактерия, содержащая профаг, становится лизогенной до тех пор, пока при определённых условиях или спонтанно профаг не будет стимулирован на осуществление литического цикла. Переход от лизогении к лизису называется лизогенной индукцией, или индукцией профага[25]. На индукцию фага оказывает сильное воздействие состояние клетки хозяина, предшествующее индукции, также как наличие питательных веществ и другие условия, имеющие место в момент индукции. Скудные условия для роста способствуют лизогенному пути, тогда как хорошие условия способствуют лизирующей реакции[16][23][24]. Известны случаи спонтанной индукции. Умеренные фаги из семейства Inoviridae способны стабильно воспроизводиться, не вызывая гибели клеток хозяина[26].
Специфичность бактериофагов
Изображение фага Enterococcus GVEsP-1 ( Herelleviridae), полученное с помощью сканирующего электронного микроскопа
Спектр активности отдельных бактериофагов (англ.host range) часто ограничен штаммами определённого вида бактерий. Однако существуют поливалентные бактериофаги, активные в отношении бактерий из разных таксонов. Например, спектры литической активности значительного числа фагов семейства Autographiviridae включают в себя разные виды, хотя и покрывают только небольшую часть внутривидового разнообразия бактерий
[27][28][29][30]. Различают следующие типы спектра активности бактериофагов: адсорбционный, трансдуктивный, бактерицидный, продуктивный, бляшкообразующий и лизогенный[31]. Бляшкообразующий спектр активности определяется способностью фага образовывать бляшки на газоне бактерий.
В то же время при малом урожае фаговых частиц продуктивная инфекция возможна без образования бляшек на бактериальном газоне. Распространённый метод тестирования литической активности на бактериальном газоне может давать ложноположительные результаты из-за лизиса бактериальных клеток без размножения вируса. Такой лизис может происходить вследствие адсорбции на бактериальной клетке большого количества фаговых частиц или активности свободных эндолизинов и бактериоцинов фагового препарата. В результате определяемый в лаборатории спектр активности зависит от применяемой методики[32]. В исследовании 2021 года пять бактериофагов семейства Herelleviridae образовывали бляшки на 51—60 % штаммов S. aureus. Однако при совместном культивировании с бактериями в жидкой среде в течение суток те же бактериофаги были способны подавить рост только 2—49 % штаммов из той же коллекции[33].
Роль бактериофагов в биосфере
Бактериофаг ϕpp2 патогенных вибрионовV. parahaemolyticus и V. alginolyticus
Бактериофаги представляют собой наиболее многочисленную, широко распространённую в биосфере и, предположительно, наиболее эволюционно древнюю группу вирусов[2][15][34]. В природных условиях фаги встречаются в тех местах, где есть чувствительные к ним бактерии, причем в некоторых экосистемах, например в водоемах, численность фаговых частиц превышает численность бактерий в 2—10 раз[источник не указан 475 дней]. Как правило, чем богаче тот или иной субстрат (почва, выделения человека и животных, вода и т. д.) микроорганизмами, тем в большем количестве в нём встречаются соответствующие фаги, но имеются и исключения[источник не указан 475 дней]. Приблизительный размер глобальной популяции фагов составляет более 1030 фаговых частиц[35]. Бактериофаги контролируют численность микробных популяций, и в водных местообитаниях косвенно измеряемый вклад фаговой инфекции в смертность бактерий составляет 10—20 %[36][37]. Помимо этого, они осуществляют горизонтальный перенос наследственного материала, привнося в бактериальный геном новые гены или новые варианты имеющихся генов. Такой перенос может осуществляться посредством трансдукции или лизогенной конверсии[38][39]. Умеренные бактериофаги в лизогенном состоянии придают своим хозяевам устойчивость к лизису генетически сходными фагами. Лишь незначительно влияя на рост "своих" бактерий, бактериофаги могут подавлять конкурирующие штаммы, тем самым являясь оружием в конкурентной борьбе[40].
Мониторинг чувствительности к бактериофагам в пресноводных и почвенных местообитаниях выявил существование непрерывных процессов совместной эволюции бактерий и вирусов, в ходе которых бактерии приобретают фагорезистентность, а бактериофаги её преодолевают[41][42]. Поскольку фаги, как правило, узкоспецифичны по отношению к хозяевам, абсолютная концентрация микробных клеток каждого штамма и активных против них бактериофагов может быть низкой (хотя общая концентрация всех бактерий и всех фагов может быть достаточно высока[2][43]. В результате, в перемешиваемых системах действует механизм kill-the-winner (убить победителя). В соответствии с ним давление фаговой инфекции на конкретную бактериальную популяцию возрастает по мере роста ее плотности. То есть, фаги вносят больший вклад в смертность экологически более успешных видов и штаммов по сравнению с минорными популяциями[2][43]. Более того, при лизисе бактериальной клетки бактериофагом большая часть биомассы бактерии преобразуется в мелкодисперсное растворимое органическое вещество, служащее питанием для других гетеротрофных бактерий. В результате фаговая инфекция не только ограничивает размножение наиболее приспособленных видов, но и перераспределяет органическое вещество. По существующим моделям до 26 % всего объема первичной продукции органического вещества в морских экосистемах поступает в пул растворённого органического вещества в результате вирусного (в основном фагового) лизиса клеток различных организмов. Таким образом, фаговая инфекция поддерживает разнообразие бактерий и стимулирует их метаболическую активность, по меньшей мере в некоторых экосистемах. В микробных сообществах, ассоциированных с продуцирующими слизь тканями животных, например, на коралловых рифах или в кишечнике млекопитающих, высокая численность бактерий способствует переходу умеренных фагов в лизогенное состояние, и лизогенная конверсия преобладает над литическим циклом. Следствиями этого являются повышенная устойчивость лизогенов к фаговой инфекции и преимущественное размножение фагов наиболее многочисленных бактерий, не сопровождающееся их гибелью. Такие отношения между вирусами и бактериями описываются моделью piggyback-the-winner (оседлать победителя)[44][45]. Для описания взаимодействия бактериальной и фаговой популяций также используют модели kill-the-competitor (убить конкурента), arms-race dynamics (динамика гонки вооружений) и fluctuating-selection dynamics (динамика флуктуирующего отбора)[46].
Бактериофаги присутствуют в значительных количествах и в наземных экосистемах. Так, фаги, лизирующие клетки различных видов почвенных микроорганизмов, находятся в почвах. Особенно[прояснить] богаты фагами чернозёмы и почвы, в которые вносились органические удобрения[источник не указан 475 дней]. Вирусные сообщества (виромы), состоящие почти целиком из бактериофагов, ассоциированны и с микробиомом тела человека и животных, особенно многочисленны и разнообразны виромы кишечника[прояснить][47]. Предполагают, что виром кишечника играет существенную роль в гомеостазе макроорганизма[уточнить] и в патогенезе некоторых заболеваний[уточнить].
Высокий уровень специализации, долгосрочное существование, способность быстро репродуцироваться в соответствующем хозяине способствует их сохранению в динамичном балансе среди широкого разнообразия видов бактерий в любой природной экосистеме. Когда подходящий хозяин отсутствует, многие фаги могут сохранять способность к инфицированию на протяжении десятилетий[23], однако в реальных экосистемах срок полужизни вирусных частиц составляет от нескольких часов до нескольких суток. Фаговые частицы инактивируются ультрафиолетовым облучением, могут необратимо связываться с различными частицами, гибнут в результате непродуктивной инфекции физиологически неактивных или мертвых клеток бактерий, могут выедаться некоторыми видами простейших, разрушаются под действием многих иных факторов. В большинстве случаев суточная продукция фаговых частиц уравновешивается их разрушением[источник не указан 475 дней].
Методы выделения фагов
Фаговый лизис бактериальной культуры Enterococcus faecalis. Видны негативные колонии, или бляшки бактериофага
Прямой метод
Фаг получают и изучают в фильтратах исследуемого материала. О наличии и активности фага узнают по лизису чувствительной к нему культуры[48].
Метод обогащения
Подготовительный фильтрат вносят в бульонную культуру соответствующих микроорганизмов. Посев инкубируют — фаг размножается в клетках культуры и, соответственно, число (титр) активных фаговых частиц увеличивается. После этого бульон фильтруют и определяют свойства и активность фага[48].
Применение
В биологии
Бактериофаги применяются в генной инженерии в качестве векторов, переносящих участки ДНК, возможна также естественная передача генов между бактериями посредством некоторых фагов (трансдукция).
Фаговые векторы обычно создают на базе умеренного бактериофага λ, содержащего двухцепочечную линейную молекулу ДНК. Левое и правое плечи фага имеют все гены, необходимые для литического цикла (репликации, размножения). Средняя часть генома бактериофага λ (содержит гены, контролирующие лизогению, то есть его интеграцию в ДНК бактериальной клетки) не существенна для его размножения и составляет примерно 25 тысяч пар нуклеотидов. Данная часть может быть заменена на чужеродный фрагмент ДНК. Такие модифицированные фаги проходят литический цикл, но лизогения не происходит. Векторы на основе бактериофага λ используют для клонирования фрагментов ДНК эукариот (то есть более крупных генов) размером до 23 тысяч пар нуклеотидов (т. п. н.). Причём, фаги без вставок — менее 38 т. п. н. или, напротив, со слишком большими вставками — более 52 т. п. н. не развиваются и не поражают бактерии[49].
Бактериофаги M13, фаг Т4, T7 и фаг λ используют для изучения белок-белковых, белок-пептидных и ДНК-белковых взаимодействий методом фагового дисплея.
Поскольку размножение бактериофага возможно только в живых клетках, бактериофаги могут быть использованы для определения жизнеспособности бактерий, например, с помощью метода электрооптического анализа клеточных суспензий[50].
Одной из областей использования бактериофагов является антибактериальная терапия, самостоятельная или как дополнение к приёму антибиотиков. Применение бактериофагов в терапевтических целях затруднено их высокой специфичностью, но оправдано при инфекциях, осложнённых антибиотикорезистентностью или развитием биоплёнок[51]. По состоянию на 2000 год терапевтическое применение бактериофагов не имело одобрения на Западе, однако в различных странах имеет место процесс развития соответствующих правовых норм. С 2018 года в Бельгии фаги производятся в рамках концепции магистральных препаратов на основании разрешений, выдаваемых сертифицированным национальным лабораториям, и применяются под прямой ответственностью врачей и фармацевтов[52]. В 2020 году фаготерапия пневмонии и бактериемии, обусловленных антибиотикорезистентными штаммами Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa и Staphylococcus aureus, получила одобрение FDA[53]. За пределами исторического Восточного блока центры фаготерапии функционируют в Бельгии[54], Израиле[55] и США[56]. Доля трудноизлечимых инфекций, при которых наблюдалось клиническое улучшение после курса фаготерапии, была оценена в 79%. Эрадикация возбудителей была достигнута в 87% опубликованных случаев[57].
Фаговые препараты используются для профилактики заболеваний[58]. Также существует практика обработки пищевых продуктов для уничтожения бактерий, вызывающих пищевые отравления, таких как листерии[59].
В современной мировой практике фаготерапия может быть показана и эффективна для персонализированного лечения пациентов в комбинации с антибиотиками[60]. По состоянию на 2022 год[61] правовые основания для персонализированного применения бактериофагов практически отсутствуют как в Российской Федерации, так и в других странах мира. Российская Федерация является единственным государством в мире, на территории которого официально внедрены фармакопейные стандарты качества препаратов бактериофагов[61]. В 2018 г. в Государственную фармакопею Российской Федерации XIV издания включены общая фармакопейная статья ОФС.1.7.1.0002.15 Бактериофаги[62] и 12 монографий (фармакопейных статей) на отдельные бактериофаги.
В растениеводстве
Бактериофаги могут быть использованы для борьбы с важными для сельского хозяйства патогенами растений. Показана их применимость для обработки растений до сбора урожая и в послеуборочной обработке продукции. Для повышения эффективности и предотвращения развития резистентности у бактериального хозяина используются высокие титры литических фагов. Препятствием применения фаговых препаратов для защиты растений является чувствительность фаговых частиц к ультрафиолету. Для увеличения продолжительности жизни фагов в филлосфере фаги могут быть нанесены вечером. Устойчивую популяцию фагов на поверхности листьев можно создать путём использования различных вспомогательных препаратов, таких как обезжиренное молоко, смешанных с растворами фагов. Также возможно использование непатогенных бактерий-носителей, обеспечивающих размножение и выживание фагов на поверхности растений[63]. В экспериментах по оценке эффективности бактериофагов для защиты картофеля был показан пятикратный прирост урожайности[64].
↑ 123456Летаров А. В. Современные концепции биологии бактериофагов. — М.: ДеЛи, 2019. — 384 с. — ISBN 978-5-6042712-4-7.
↑ 12Abedon ST, Thomas-Abedon C, Thomas A, Mazure H (2011). "Bacteriophage prehistory: Is or is not Hankin, 1896, a phage reference?". Bacteriophage. 1 (3): 174—178. doi:10.4161/bact.1.3.16591. PMID22164351.
↑ 12345678910А.В. Летаров. История ранних исследований бактериофагов и рождение основных концепций вирусологии (рус.) // Биохимия : журнал. — 2020. — Т. 85, № 9. — С. 1189–1212. — doi:10.31857/S0320972520090031.
↑McCallin, S. Clinical Trials of Bacteriophage Therapeutics // Bacteriophages / S McCallin, H Brüssow. — Cham : Springer, 2017. — doi:10.1007/978-3-319-40598-8_38-1.
↑Atterbury, RJ. The Use of Bacteriophages in Veterinary Therapy // Bacteriophages / RJ Atterbury, PA Barrow. — Cham : Springer, 2019. — doi:10.1007/978-3-319-40598-8_32-1.
↑Ковалёва Е. Н. Создание биопрепарата на основе выделенных и изученных бактериофагов Enterococcus faecalis: Дис. … канд. биол. наук. — Саратов, 2009. — 151 с.
↑Molecular Medical Microbiology / Yi-Wei Tang, Max Sussman, Dongyou Liu, Ian Poxton, Joseph Schwartzman. — 2 ed. — Academic Press, 2014. — Vol. 1. — P. 579. — 2216 p. — ISBN 9780123977632.
↑Al-Shayeb B; Sachdeva R; Chen LX; et al. (2020). "Clades of huge phages from across Earth's ecosystems". Nature. 578 (7795): 425—431. doi:10.1038/s41586-020-2007-4. PMID32051592.
↑Virus Taxonomy. Classification and Nomenclature of Viruses. Seventh Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses / Edited by M. H. V. van Regenmontel et al. — San Diego: Academic Press, 2000. — P. 43—53, 64—129.
↑ 12345Guttman B., Raya R., Kutter E. Basic Phage Biology, in Bacteriophages: Biology and Applications, (Kutter E. and Sulakvelidze A., ed.), CRP Press, 2005 FL. — P. 29-66.
↑ 12Микробиология: учеб. пособие / В. В. Лысак. — Минск: БГУ, 2007. — 430 с.
↑Raya R.R., Hébert E.M. Isolation of phage via induction of lysogens. Bacteriophages: Methods and Protocols, Volume 1: Isolation, Characterization, and Interaction (Martha R.J. Clokie, Andrew M. Kropinski (eds.), 2009. — V. 501. — P. 23-32.
↑Salem M; Virtanen S; Korkeala H; Skurnik M (2015). "Isolation and characterization of Yersinia-specific bacteriophages from pig stools in Finland". J Appl Microbiol. 118 (3): 599—608. doi:10.1111/jam.12722. PMID25495090.
↑Oliveira H; Costa AR; Konstantinides N; Ferreira A; Akturk E; Sillankorva S; Nemec A; Shneider M; Dötsch A; Azeredo J (2017). "Ability of phages to infect Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii complex species through acquisition of different pectate lyase depolymerase domains". Environ Microbiol. 19 (12): 5060—5077. doi:10.1111/1462-2920.13970. PMID29076652.
↑Jun JW; Park SC; Wicklund A; Skurnik M (2018). "Bacteriophages reduce Yersinia enterocolitica contamination of food and kitchenware". Int J Food Microbiol. 271: 33–47. doi:10.1016/j.ijfoodmicro.2018.02.007. PMID29477807.
↑Zaczek-Moczydłowska MA; Young GK; Trudgett J; Plahe C; Fleming CC; Campbell K; O'Hanlon R (2020). "Phage cocktail containing Podoviridae and Myoviridae bacteriophages inhibits the growth of Pectobacterium spp. under in vitro and in vivo conditions". PLoS One. 15 (4): e0230842. doi:10.1371/journal.pone.0230842. PMID32240203.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
↑Ross A; Ward S; Hyman P (2016). "More is better: selecting for broad host range bacteriophages". Frontiers in Microbiology. 7: 1352. doi:10.3389/fmicb.2016.01352. PMID27660623.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
↑Sáez Moreno D; Visram Z; Mutti M; Restrepo-Córdoba M; Hartmann S; Kremers AI; Tišáková L; Schertler S; Wittmann J; Kalali B; et al. (2021). "ε2-phages are naturally bred and have a vastly improved host range in Staphylococcus aureus over wild type phages". Pharmaceuticals (Basel). 15 (4): 325. doi:10.3390/ph14040325. PMID33918287.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
↑Hendrix RW (2002). "Bacteriophages: evolution of the majority". Theoretical Population Biology. 61 (4): 471—480. doi:10.1006/tpbi.2002.1590. PMID12167366.
↑Suttle CA (1994). "The significance of viruses to mortality in aquatic microbial communities". Microb Ecol. 28 (2): 237—243. doi:10.1007/BF00166813. PMID24186450.
↑Duhamel S; Domaizon-Pialat I; Personnic S; Jacquet S (2006). "Assessing the microbial community dynamics and the role of bacteriophages in bacterial mortality in Lake Geneva". Revue des sciences de l'eau. 19 (2): 115—126. doi:10.7916/d8-twsz-xt06.
↑Шестаков С. В. Как происходит и чем лимитируется горизонтальный перенос генов у бактерий. Экологическая генетика 2007. — Т. 5. — № 2. — C. 12-24.
↑Touchon M; Moura de Sousa JA; Rocha EP (2017). "Embracing the enemy: the diversification of microbial gene repertoires by phage-mediated horizontal gene transfer". Curr Opin Microbiol. 38: 66—73. doi:10.1016/j.mib.2017.04.010. PMID28527384.
↑Thomas MJN, Brockhurst MA, Coyte KZ. What makes a temperate phage an effective bacterial weapon? mSystems. 2024;9(6):e0103623. doi: 10.1128/msystems.01036-23. PMID 38727217
↑Laanto E, Hoikkala V, Ravantti J, Sundberg LR. Long-term genomic coevolution of host-parasite interaction in the natural environment. Nat Commun. 2017;8(1):111. doi: 10.1038/s41467-017-00158-7. PMID 28740072
↑Dewald-Wang EA, Parr N, Tiley K, Lee A, Koskella B. Multiyear Time-Shift Study of Bacteria and Phage Dynamics in the Phyllosphere. Am Nat. 2022;199(1):126–140. doi: 10.1086/717181. PMID 34978974
↑Brown TL; Charity OJ; Adriaenssens EM (2023). "Ecological and functional roles of bacteriophages in contrasting environments: marine, terrestrial and human gut". Curr Opin Microbiol. 70: 102229. doi:10.1016/j.mib.2022.102229. PMID36347213.
↑Shkoporov AN, Hill C (2019). "Bacteriophages of the Human Gut: The "Known Unknown" of the Microbiome". Cell Host & Microbe. 25 (2): 195—209. doi:10.1016/j.chom.2019.01.017. PMID30763534.
↑ 12Камышева К. С. Основы микробиологии и иммунологии. — 2-е изд. — Ростов н/Д.: Феникс, 2019. — 381 с. — ISBN 978-5-222-31587-3.
↑Щелкунов С. Н. Генетическая инженерия / С. Н. Щелкунов. — Новосибирск: Сиб. унив. изд-во, 2004. — 496 с.
↑Guliy OI, Bunin VD, O'Neil D, Ivnitski D, Ignatov OV (2007). "A new electro-optical approach to rapid assay of cell viability". Biosensors and Bioelectronics. 23 (4): 583—587. doi:10.1016/j.bios.2007.06.008. PMID17764921.
↑Pirnay JP; Verbeken G (2023). "Magistral phage preparations: is this the model for everyone?". Clinical Infectious Diseases. 77 (Supplement_5): S360–S369. doi:10.1093/cid/ciad481. PMID37932120.
↑Djebara S; Maussen C; De Vos D; et al. (2019). "Processing phage therapy requests in a Brussels military hospital: lessons identified". Viruses. 11 (3): 265. doi:10.3390/v11030265. PMID30884879.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
↑Onallah H; Hazan R; Nir-Paz R; et al. (2023). "Compassionate use of bacteriophages for failed persistent infections during the first 5 years of the Israeli phage therapy center". Open Forum Infectious Diseases. 10 (5): ofad221. doi:10.1093/ofid/ofad221. PMID37234511.
↑Aslam S; Lampley E; Wooten D; et al. (2020). "Lessons learned from the first 10 consecutive cases of intravenous bacteriophage therapy to treat multidrug-resistant bacterial infections at a single center in the United States". Open Forum Infectious Diseases. 7 (9): ofaa389. doi:10.1093/ofid/ofaa389. PMID33005701.
↑Uyttebroek S; Chen B; Onsea J; et al. (2022). "Safety and efficacy of phage therapy in difficult-to-treat infections: a systematic review". The Lancet Infectious Diseases. 22 (8): e208—e220. doi:10.1016/S1473-3099(21)00612-5. PMID35248167.
↑Jean-Paul Pirnay, Sarah Djebara, Griet Steurs, Johann Griselain, Christel Cochez, Steven De Soir, Tea Glonti, An Spiessens, Emily Vanden Berghe, Sabrina Green, Jeroen Wagemans, Cédric Lood, Eddie Schrevens, Nina Chanishvili, Mzia Kutateladze, Mathieu de Jode, Pieter-Jan Ceyssens, Jean-Pierre Draye, Gilbert Verbeken, Daniel De Vos, Thomas Rose, Jolien Onsea, Brieuc Van Nieuwenhuyse, Bacteriophage Therapy Providers, Kim Win Pang, Willem-Jan Metsemakers, Dimitri Van der Linden, Olga Chatzis, Anaïs Eskenazi, Angel Lopez, Adrien De Voeght, Anne Françoise Rousseau, Anne Tilmanne, Daphne Vens, Jean Gérain, Brice Layeux, Erika Vlieghe, Ingrid Baar, Sabrina Van Ierssel, Johan Van Laethem, Julien Guiot, Sophie De Roock, Serge Jennes, Saartje Uyttebroek, Laura Van Gerven, Peter W. Hellings, Lieven Dupont, Yves Debaveye, David Devolder, Isabel Spriet, Paul De Munter, Melissa Depypere, Michiel Vanfleteren, Olivier Cornu, Stijn Verhulst, Tine Boiy, Stoffel Lamote, Thibaut Van Zele, Grégoire Wieërs, Cécile Courtin, David Lebeaux, Jacques Sartre, Tristan Ferry, Frédéric Laurent, Kevin Paul, Mariagrazia Di Luca, Stefan Gottschlich, Tamta Tkhilaishvili, Novella Cesta, Karlis Racenis, Telma Barbosa, Luis Eduardo López-Cortés, Maria Tomás, Martin Hübner, Truong-Thanh Pham, Paul Nagtegaal, Jaap Ten Oever, Johannes Daniels, Maartje Loubert, Ghariani Iheb, Joshua Jones, Lesley Hall, Matthew Young, Bacteriophage Donors, Nana Balarjishvili, Marina Tediashvili, Yigang Tong, Christine Rohde, Johannes Wittmann, Ronen Hazan, Ran Nir-Paz, Joana Azeredo, Victor Krylov, David Cameron, Melissa Pitton, Yok-Ai Que, Gregory Resch, Shawna McCallin, Matthew Dunne, Samuel Kilcher, Patrick Soentjens, Rob Lavigne, Maya Merabishvili.Personalized bacteriophage therapy outcomes for 100 consecutive cases: a multicentre, multinational, retrospective observational study (англ.) // Nature Microbiology. — 2024-06-04. — Vol. 9, iss. 6. — P. 1434–1453. — ISSN2058-5276. — doi:10.1038/s41564-024-01705-x.
Armistizio di CassibileIl generale italiano Castellano stringe la mano al generale statunitense Eisenhower dopo la firma dell'armistizio. A sinistra si trova il generale Walter Bedell Smith.Tipotrattato bilaterale ContestoSeconda guerra mondiale Firma3 settembre 1943 LuogoCassibile, Siracusa (Italia) Efficacia8 settembre 1943 (con il proclama Badoglio) Parti Italia Stati Uniti Firmatari Giuseppe Castellano Walter Bedell Smith Lingueitalianoinglese voci di trattati presenti su Wikipe...
Lambang kota Untuk pengertian lain, lihat Boal. Boal (bahasa Asturia dan Eonaviego: Bual[1]) adalah kotamadya yang berada di Eo-Navia, Asturias, Spanyol. Secara administratif, Boal termasuk pula ke dalam distrik peradilan Valdés. Pusat kotamadya ini ada di Paroki Bual. Kotamadya berpenduduk 2.040 jiwa (2008) ini mencakup daerah seluas 120,28 km², sehingga kepadatan penduduknya mencapai 16,96 jiwa/km². Geografi Boal berada di kawasan timur Asturia, dan kota ini terletak 450 m d...
MlatiKapanewonNegara IndonesiaProvinsiDaerah Istimewa YogyakartaKabupatenSlemanPemerintahan • PanewuDrs. Suyudi, MM.Populasi • Total72,436 jiwa jiwaKode Kemendagri34.04.06 Kode BPS3404060 Luas- km²Desa/kelurahan- Mlati (Jawa: ꦩ꧀ꦭꦛꦶ, translit. Mlathi) adalah sebuah kapanéwon di Kabupaten Sleman, Daerah Istimewa Yogyakarta, Indonesia. Kapanewon Mlati berada di sebelah Selatan dari Ibu kota Kabupaten Sleman. Demografi Kapanéwon Mlati dihuni oleh...
Physical money This article is about physical money. For money in general, see Money. For other uses, see Cash (disambiguation). Banknotes and coins of various currencies In economics, cash is money in the physical form of currency, such as banknotes and coins. In bookkeeping and financial accounting, cash is current assets comprising currency or currency equivalents that can be accessed immediately or near-immediately (as in the case of money market accounts). Cash is seen either as a reserv...
Capital city of New York, United States State capital in New York, United StatesAlbanyState capitalClockwise from top: Downtown from Rensselaer; middle-class housing in the Helderberg neighborhood; Palace Theatre; Empire State Plaza from the Cultural Education Center; North Pearl Street at Columbia Street; and the State Quad at SUNY Albany FlagSealCoat of armsEtymology: Named for the Scottish Duke of Albany, whose title comes from the Gaelic name for Scotland: AlbaNicknames: Smalbany[...
لمعانٍ أخرى، طالع جون هنتر (توضيح). جون هنتر معلومات شخصية الميلاد 13 فبراير 1728 [1][2][3][4] الوفاة 16 أكتوبر 1793 (65 سنة) [1][2][3][4] لندن سبب الوفاة نوبة قلبية مكان الدفن دير وستمنستر مواطنة مملكة بريطانيا العظمى عضو في الج...
Tuberculum sellaeSphenoid bone. Upper surface. (Tuberculum sellae visible at center.)Base of the skull. Upper surface. (Sphenoid bone visible in yellow, the tuberculum sellae is labeled at the right, fourth from the top of the yellow section.)IdentifiersTA98A02.1.05.007TA2590FMA54719Anatomical terminology[edit on Wikidata] The tuberculum sellae (or the tubercle of the sella turcica) is a slight[1] median elevation upon the superior aspect of the body of sphenoid bone (that forms t...
Seorang pemandu wisata. Pramuwisata atau pemandu wisata (Inggris: tour guide) adalah seseorang yang memberikan informasi terkait warisan kultural, bersejarah, dan kontemporer kepada sekumpulan wisatawan atau individu yang terorganisir. Di Indonesia, secara nasional telah dibentuk organisasi yang mewadahi profesi ini, yaitu Himpunan Pramuwisata Indonesia atau HPI. Organisasi ini telah memiliki jaringan ke seluruh provinsi di Indonesia. Di beberapa daerah juga terbentuk sejumlah organisasi ...
Pour les articles homonymes, voir Gary. Romain GaryRomain Gary et Jean Seberg à Rome en 1961.BiographieNaissance 21 mai 1914Vilnius (Empire russe)Décès 2 décembre 1980 (à 66 ans)7e arrondissement de Paris (France)Nom de naissance Roman KacewPseudonymes Fosco Sinibaldi, Shatan Bogat, Émile Ajar, Romain Gary, Lucien Brulard, René DevilleNationalités française (à partir de 1935)lituaniennepolonaiseDomiciles Vilnius (d) (1914-1925), Nice (1928-1934), rue du Bac (1963-1980)Formatio...
Removal of atmospheric carbon dioxide through human activity This article is about removing carbon dioxide from the atmosphere. For technologies that remove carbon dioxide from point sources, see Carbon capture and storage. Planting trees is a nature-based way to temporarily remove carbon dioxide from the atmosphere.[1][2] Carbon dioxide removal (CDR) is a process in which carbon dioxide (CO2) is removed from the atmosphere by deliberate human activities and durably stored in ...
Japanese light transport aircraft Ki-56 Role Light transportType of aircraft Manufacturer Kawasaki Kōkūki Kōgyō K.K. Designer Takeo Doi Introduction 1940 Produced 1940-1943 Number built 121 Developed from Lockheed Model 14 Super Electra The Kawasaki Ki-56 (Japanese: 一式貨物輸送機, Type 1 Freight Transport) was a Japanese two-engine light transport aircraft used during World War II. It was known to the Allies by the reporting name Thalia. 121 were built between 1940 and 1943. Desig...
Wars involving the United Kingdom This is a list of humanitarian conflicts involving the United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland and its predecessor states (the Kingdom of Great Britain, Kingdom of England, Kingdom of Scotland and generally the British Isles). Notable militarised interstate disputes are included. For a list of wars before the Acts of Union 1707 please see List of wars involving England & List of wars involving Scotland. To see wars that have been fought on th...
شمس الدين الزركشي معلومات شخصية تاريخ الميلاد سنة 1322 الوفاة 13 ديسمبر 1370 (47–48 سنة) القاهرة مكان الدفن القرافة مواطنة الدولة العثمانية الحياة العملية المهنة فقيه تعديل مصدري - تعديل شمس الدين أبو عبد الله محمد بن عبد الله بن محمد الزركشي المصري (722 ه...
Wakil Bupati BulelengSinga ambara rajaPetahanadr. I Nyoman Sutjidra, Sp.OG.sejak 27 Agustus 2017Masa jabatan5 tahunDibentuk2002Pejabat pertamaI Gede WardanaSitus webbulelengkab.go.id Berikut ini adalah daftar Wakil Bupati Buleleng dari masa ke masa. No Wakil Bupati Mulai Jabatan Akhir Jabatan Prd. Ket. Bupati 1 Drs.I Gede WardanaM.Si. 2002 11 Mei 2007 1 Putu Bagiada Jabatan kosong 11 Mei 2007 24 Juli 2007 Drs.I Gede WardanaM.Si. 2 Made Arga Pynatih 24 Juli 2007 24 Juli 2012...
A major contributor to this article appears to have a close connection with its subject. It may require cleanup to comply with Wikipedia's content policies, particularly neutral point of view. Please discuss further on the talk page. (October 2017) (Learn how and when to remove this message) Salem Chapel is a former Congregational church, located on Hunslet Lane, Leeds, West Yorkshire, England.[1] It is situated opposite the former Tetley's Brewery.[2] Salem Chapel, Leeds His...
Hidayatullah IISultan Hidajat-Oellah Halil-Illah (ejaan Belanda)Lukisan Sultan Hidayatullah II di Museum Lambung MangkuratSultan Banjar XVBerkuasaSeptember 1859 – 2 Maret 1862PenobatanSeptember 1859 di Banua LimaPendahuluTamjidullah IIPenerusPanembahan AmiruddinMangkubumi BanjarBerkuasa9 Oktober 1856 – 5 Februari 1860Penobatan9 Oktober 1856Informasi pribadiKelahiranGusti Andarun1822Martapura, Kesultanan BanjarKematian24 November 1904(1904-11-24) (umur 81–82)Cianjur, Karesidenan Par...
