PROFILPELAJAR.COM

SEMA7A
SEMA7A
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	3NVQ
Идентификаторы
Псевдонимы	SEMA7A, CD108, CDw108, H-SEMA-K1, H-Sema-L, JMH, SEMAK1, SEMAL, semaphorin 7A (John Milton Hagen blood group), PFIC11
Внешние ID	OMIM: 607961 MGI: 1306826 HomoloGene: 2678 GeneCards: SEMA7A
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	15-я хромосома человека
Конец	74,433,958 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	9-я хромосома мыши
Конец	57,870,148 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	C1 segment; ; primary visual cortex; ; right hemisphere of cerebellum; ; stromal cell of endometrium; ; цитоархитектоническое поле Бродмана 9;
	Наибольшая экспрессия в
	cumulus cell; ; primary visual cortex; ; lumbar subsegment of spinal cord; ; anterior horn of spinal cord; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; lobe of cerebellum;
	Дополнительные справочные данные
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание с белками плазмы; integrin binding; neuropilin binding; semaphorin receptor binding; chemorepellent activity;
Компонент клетки	мембрана; клеточная мембрана; anchored component of membrane; внеклеточное пространство; наружная сторона клеточной мембраны; часть клеточной мембраны; collagen-containing extracellular matrix;
Биологический процесс	дифференцировка клеток; positive regulation of protein phosphorylation; развитие нервной системы; развитие многоклеточного организма; osteoblast differentiation; иммунный ответ; positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; axon extension; olfactory lobe development; integrin-mediated signaling pathway; positive regulation of axon extension; воспалительная реакция; neuron projection development; regulation of inflammatory response; negative chemotaxis; positive regulation of macrophage cytokine production; neural crest cell migration; positive regulation of cell migration; negative regulation of axon extension involved in axon guidance; semaphorin-plexin signaling pathway;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	8482
	20361
	ENSG00000138623; ENSG00000288455
	ENSMUSG00000038264
	O75326
	Q9QUR8
	NM_003612; NM_001146029; NM_001146030
	NM_011352
	NP_001139501; NP_001139502; NP_003603
	NP_035482
	Информация в Викиданных
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

Семафорин-7A (англ. Semaphorin 7A, GPI membrane anchor; SEMA7A; CD108) — мембранный гликопротеин класса семафоринов, прикреплён к клеточной мембране за счёт гликозилфосфатидилинозитольной группы. Антиген группы крови John-Milton-Hagen (JMH). Продукт гена человека SEMA7A^[5].

Структура

SEMA7A состоит из 666 аминокислот, молекулярная масса 74,8 кДа. Содержит один Ig-подобный домен типа C2. Гликозилфосфатидилинозитол заякоривает белок на мембране.

Взаимодействует с интегринами ITGA1 и ITGB1 и с рецептором семафоринов PLXNC1.

Функции

SEMA7A играет важную роль в интегрин-опосредованной передаче сигнала. Функционирует в регуляции клеточной миграции и в иммунном ответе. Стимулирует образование комплексов фокальной адгезии, активацию протеинкиназы PTK2/FAK1 и последующее фосфорилирование киназ MAPK1 и MAPK3. Стимулирует продукцию воспалительных цитокинов моноцитами и макрофагами. Играет важную роль в модулировании воспалительной реакции и T-клеточного иммунного ответа. Белок стимулирует рост аксонов в эмбриональной обонятельной луковице. Участвует в прикреплении меланоцитов, их росте и образовании дендритных отростков.

Кроме этого, белок служит рецептором малярийного паразита Plasmodium falciparum.

Группа крови JMH

Система группы крови John Milton Hagen (JMH) — высокочастотный антиген эритроцитарной группы крови человека.^[6] Система состоит из 6 антигенов, расположенных на семафорине-7A^[7], но, как правило, они не вызывают существенного гемолиза или гемолитических расстройств новорожденных.^[8]

Тканевая локализация

Белок экспрессирован на активированных лимфоцитах и эритроцитах. Детектируется на кератиноцитах, эндотелиальных клетках кровеносных сосудов кожи. Экспрессирован на фибробрастах, меланоцитах, в плаценте, яичках, яичниках, селезёнке, мозге, спинном мозге, лёгких, сердце, надпочечниках, лимфатических узлах, вилочковой железе, кишечнике и почках.

Примечания

↑ ¹ ² ³ ENSG00000288455 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000138623, ENSG00000288455 - Ensembl, May 2017
↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038264 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Entrez Gene: SEMA7A semaphorin 7A, GPI membrane anchor (John Milton Hagen blood group) (неопр.).
↑ Bobolis, Kristie A.; Moulds, John J.; Telen, Marilyn J. Isolation of the JMH Antigen on a Novel Phosphatidylinositol-Linked Human Membrane Protein (англ.) : journal. Архивировано 21 октября 2018 года.
↑ Johnson, S.T. JMH blood group system: a review. (неопр.) // Immunohematology. — 2014. — Т. 30, № 1. — С. 18—23. — PMID 25238240.
↑ JMH (неопр.). bbguy.org. Дата обращения: 21 октября 2018. Архивировано 21 октября 2018 года.

Литература

Xu X., Ng S., Wu Z.L., etal. Human semaphorin K1 is glycosylphosphatidylinositol-linked and defines a new subfamily of viral-related semaphorins. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1998. — Vol. 273, no. 35. — P. 22428—22434. — doi:10.1074/jbc.273.35.22428. — PMID 9712866.
Lange C., Liehr T., Goen M., etal. New eukaryotic semaphorins with close homology to semaphorins of DNA viruses. (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1998. — Vol. 51, no. 3. — P. 340—350. — doi:10.1006/geno.1998.5256. — PMID 9721204.
Yamada A., Kubo K., Takeshita T., etal. Molecular cloning of a glycosylphosphatidylinositol-anchored molecule CDw108. (англ.) // J. Immunol. : journal. — 1999. — Vol. 162, no. 7. — P. 4094—4100. — PMID 10201933.
Angelisová P., Drbal K., Cerný J., etal. Characterization of the human leukocyte GPI-anchored glycoprotein CDw108 and its relation to other similar molecules. (англ.) // Immunobiology : journal. — 1999. — Vol. 200, no. 2. — P. 234—245. — doi:10.1016/s0171-2985(99)80073-4. — PMID 10416131.
Tamagnone L., Artigiani S., Chen H., etal. Plexins are a large family of receptors for transmembrane, secreted, and GPI-anchored semaphorins in vertebrates. (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1999. — Vol. 99, no. 1. — P. 71—80. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80063-X. — PMID 10520995.
Mine T., Harada K., Matsumoto T., etal. CDw108 expression during T-cell development. (англ.) // Tissue Antigens^[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 55, no. 5. — P. 429—436. — doi:10.1034/j.1399-0039.2000.550505.x. — PMID 10885563.
Holmes S., Downs A.M., Fosberry A., etal. Sema7A is a potent monocyte stimulator. (неопр.) // Scand. J. Immunol.. — 2002. — Т. 56, № 3. — С. 270—275. — doi:10.1046/j.1365-3083.2002.01129.x. — PMID 12193228.
Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., etal. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., etal. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs. (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2004. — Vol. 36, no. 1. — P. 40—5. — doi:10.1038/ng1285. — PMID 14702039.
Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A., etal. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). (англ.) // Genome Res. : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
Maurin J.C., Delorme G., Machuca-Gayet I., etal. Odontoblast expression of semaphorin 7A during innervation of human dentin. (англ.) // Matrix Biol.^[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 24, no. 3. — P. 232—238. — doi:10.1016/j.matbio.2005.03.005. — PMID 15907379.
Hu Y., Malone J.P., Fagan A.M., etal. Comparative proteomic analysis of intra- and interindividual variation in human cerebrospinal fluid. (англ.) // Mol. Cell. Proteomics : journal. — 2006. — Vol. 4, no. 12. — P. 2000—2009. — doi:10.1074/mcp.M500207-MCP200. — PMID 16199891.
Koh J.M., Oh B., Lee J.Y., etal. Association study of semaphorin 7a (sema7a) polymorphisms with bone mineral density and fracture risk in postmenopausal Korean women. (англ.) // J. Hum. Genet.^[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 51, no. 2. — P. 112—117. — doi:10.1007/s10038-005-0331-z. — PMID 16372136.