Od 1942 do 1944 kierował kursami teologicznymi prowadzonymi przy Ławrze Poczajowskiej. W 1943 otrzymał godność jej namiestnika, którą sprawował przez trzy lata, do wyświęcenia na biskupa kamieniecko-podolskiego i proskurowskiego. Jego chirotonia biskupia miała miejsce 28 kwietnia 1946 z udziałem konsekratorów: metropolity kijowskiego Jana, biskupów mukaczewskiegoNestora i czernihowskiego Borysa. Urząd biskupa kamienieckiego sprawował do 1948. Został następnie przeniesiony na katedrę wołyńską, której ordynariuszem był przez kolejne cztery lata. W 1952 przeniesiony ponownie, tym razem do eparchii lwowskiej, otrzymując równocześnie godność arcybiskupią. W 1956 ponownie objął zarząd eparchii wołyńskiej. Sześć lat później odszedł w stan spoczynku. Nadal mieszkał w Równem.
16 listopada 1962, cztery miesiące po przeniesieniu w stan spoczynku, został wyznaczony na biskupa czernihowskiego i nieżyńskiego. 20 listopada tego samego roku nominacja ta została odwołana z powodu choroby hierarchy.
Pankracy (Kaszperuk) zmarł w 1972 w Równem i został pochowany na cmentarzu mnichów Ławry Poczajowskiej.