Kaisen var fra 1920 til 1928 og dessuten i 1933 senator for velferdssaker i Bremen og medlem av Bremens borgerskap som er delstatens parlament.[5] Tiden under nasjonalsosialismen tilbrakte han sammen med sin familie som bonde i bydelen Borgfeld i Bremen.
Wilhelm Kaisen preget den politiske og økonomiske gjenoppbyggingen av hansabyen fra avslutningen av den andre verdenskrigen i 1945, til han gikk ut av senatet i 1965.
Utenrikspolitisk gikk Kaisen inn for en vestorientering av Forbundsrepublikken Tyskland og en europeisk integrasjon. Han var populær i folket, men ofte omstridt i partiet SPD. Beslutningen om å gjøre Tyskland medlem av NATO som Kaisen var for, førte til brudd mellom Kaisen og SPDs daværende leder Kurt Schumacher.