MIAT 몽골 항공은 다음과 같은 노선들을 운항하고 있다.

• 대한민국
  • 서울 - 인천국제공항
  • 부산 - 김해국제공항
• 중화인민공화국
  • 베이징 - 베이징 서우두 국제공항
• 일본
  • 도쿄 - 나리타 국제공항
  • 오사카 - 간사이 국제공항 계절편
• 몽골
  • 울란바타르 - 신 울란바토르 국제공항 허브
• 홍콩
  • 홍콩 - 홍콩 국제공항

• 태국
  • 방콕 - 수완나품 국제공항
  • 푸켓 - 푸켓 국제공항

• 독일
  • 프랑크푸르트 - 프랑크푸르트 국제공항 계절편

• 러시아
  • 모스크바 - 셰레메티예보 국제공항
• 튀르키예
  • 이스탄불 - 이스탄불 공항

• 대한민국
  • 서울 - 김포국제공항
• 중화인민공화국
  • 얼롄하오터 - 얼롄하오터 사이우수 국제공항
  • 후허하오터 - 후허하오터 바이타 국제공항
• 몽골
  • 울란바토르 - 칭기즈 칸 국제공항 - 허브 이전
  • 므릉 - 므릉 공항
  • 불간 - 불간 공항
  • 아르바이키르 - 아르바이키르 공항
  • 알타이 - 알타이 공항
  • 호브드 - 호브드 공항
• 조선민주주의인민공화국
  • 평양 - 평양 순안 국제공항

• 싱가포르
  • 싱가포르 - 싱가포르 창이 국제공항
• 필리핀
  • 세부 - 막탄 세부 국제공항

• 아랍에미리트
  • 두바이 - 두바이 국제공항 계절편

• 우즈베키스탄
  • 타슈켄트 - 타슈켄트 국제공항
• 카자흐스탄
  • 아스타나 - 아스타나 국제공항
  • 알마티 - 알마티 국제공항
• 키르기스스탄
  • 비슈케크 - 마나스 국제공항

• 이탈리아
  • 밀라노 - 밀라노 말펜사 국제공항
• 튀르키예
  • 앙카라 - 에센보아 국제공항
  • 이스탄불 - 아타튀르크 국제공항

• 러시아
  • 예카테린부르크 - 콜초보 국제공항
  • 이르쿠츠크 - 이르쿠츠크 국제공항
• 체코
  • 프라하 - 프라하 바츨라프 하벨 국제공항