국보로 지정되어 있는 마쓰모토성이나 일본 알프스의 등산구로서 유명하다. 현청 소재지는 아니지만 나가노 FM방송의 본사, 일본은행 마쓰모토 지점, 마쓰모토 공항, 나가노 현의 가장 큰 대학인 신슈 대학과 육상자위대 마쓰모토 주둔지 등이 있어 마치 현 중부에 있는 "부현도(副県都)"와 같은 존재가 되어있다. 상업 판매액은 나가노 시에 이어 현내 2위이지만 시가지형 복합 점포의 수는 현내에서 가장 많다. 또한 공업 생산액이 아즈미노시, 우에다시에 이어 현내 3위로 나가노 현의 공업 거점의 하나이다.
지리
마쓰모토 시는 나가노 현의 중앙으로부터 약간 서쪽에 있고 현청 소재지의 나가노시에서 남서쪽으로 75km, 도쿄 23구에서 서북쪽으로 240km 떨어진 곳에 있다. 2005년의 합병 후의 시역은 서쪽의 히다산맥(북 알프스, 서산, 3000m급)으로부터 동쪽의 지쿠마 산지(우쓰쿠시가하라, 동산, 2000m급)까지 광대하고 나가노 현내에서는 가장 넓다. 마쓰모토 시가지(마쓰모토역 주변 등)는 두 개의 산맥(산지)의 사이에 있는 마쓰모토 분지의 중앙부, 복합 선상지상에 있다(해발 약 600m).
강으로는 가미코치 방면에서 흐르기 시작하는 아즈사가와 강이 시의 서부를 흐르고 나라이 강이 시를 이분하듯이 횡단하고 있다. 또 시가지에는 청류인 메토바 강이 횡단하고 있다. 산으로는 합병과 함께 일본 100대 명산 중 다수가 마쓰모토 시에 편입되어 산의 도시로서의 측면이 강해졌다. 주부 산악 국립공원, 야쓰카타케 주신 고원 국립공원이 시내에 있다.
시내에는 다수의 선상지가 형성되어 있다. 또 마쓰모토 시는 대지구대 위에 있고 시 서부에는 이토이가와-시즈오카 구조선이 지나고 있다. 삼림면적은 74,000 ha로 시역 전체의 약 81%를 차지한다.
기후
쾨펜의 기후 구분으로는 온난 습윤 기후(Cfa)와 냉대 습윤 기후(Df)로 나뉜다. 일본식의 기후 구분으로는 아즈미 지구를 제외하고 중앙 고원형의 대륙성 기후, 중앙 고지식 기후가 현저하게 나타나는 곳으로 대부분의 학교 교육용의 지도책에서 중앙 고원형 기후의 도시의 예로서 다루어지고 있다. 기본적으로는 평야부는 강수량이 적고 일조 시간이 많다. 가미코치나 노리쿠라 고원, 우쓰쿠시가하라 등의 산악 지대는 약간 강수량이 많아지고 일조 시간은 적어진다. 아즈미 지구는 동해측 기후로 겨울에 눈이 많아 폭설 지대로 지정되어 있다.