GRIK2

GRIK2
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	3QXM, 5CMM
識別子
記号	GRIK2, EAA4, GLR6, GLUK6, GLUR6, GluK2, MRT6, glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2, NEDLAS
外部ID	OMIM: 138244 MGI: 95815 HomoloGene: 40717 GeneCards: GRIK2
遺伝子の位置 (ヒト)
染色体	6番染色体 (ヒト)
終点	102,081,622 bp
遺伝子の位置 (マウス)
染色体	10番染色体 (マウス)
終点	49,788,766 bp
RNA発現パターン
	; ;
	さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能	• glutamate receptor activity; • PDZ domain binding; • kainate selective glutamate receptor activity; • protein homodimerization activity; • イオンチャネル活性; • ionotropic glutamate receptor activity; • identical protein binding; • ligand-gated ion channel activity; • extracellularly glutamate-gated ion channel activity; • シグナル伝達受容体活性; • ubiquitin conjugating enzyme binding; • ubiquitin protein ligase binding; • ligand-gated ion channel activity involved in regulation of presynaptic membrane potential; • transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential;
細胞の構成要素	• integral component of membrane; • 細胞体; • postsynaptic membrane; • 膜; • 細胞膜; • シナプス; • integral component of plasma membrane; • 細胞結合; • 終末ボタン; • 神経繊維; • 樹状突起; • dendrite cytoplasm; • ionotropic glutamate receptor complex; • シナプス後肥厚; • kainate selective glutamate receptor complex; • presynaptic membrane; • soma; • hippocampal mossy fiber to CA3 synapse; • glutamatergic synapse;
生物学的プロセス	• neuron apoptotic process; • glutamate receptor signaling pathway; • シナプス伝達の制御; • イオン輸送; • receptor clustering; • イオン経膜輸送; • positive regulation of neuron apoptotic process; • regulation of JNK cascade; • ionotropic glutamate receptor signaling pathway; • positive regulation of synaptic transmission; • 興奮性シナプス後電位; • negative regulation of synaptic transmission, glutamatergic; • 化学的シナプス伝達; • behavioral fear response; • cellular calcium ion homeostasis; • intracellular protein transport; • 神経活動電位; • synaptic transmission, glutamatergic; • 膜電位の制御; • negative regulation of neuron apoptotic process; • regulation of long-term neuronal synaptic plasticity; • regulation of short-term neuronal synaptic plasticity; • 抑制性; • regulation of presynaptic membrane potential;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	2898
	14806
	ENSG00000164418
	ENSMUSG00000056073
	Q13002
	P39087
	NM_001166247; NM_021956; NM_175768
	NM_001111268; NM_010349
	NP_001159719; NP_068775; NP_786944
	NP_001104738; NP_034479; NP_001345795
	ウィキデータ
閲覧/編集ヒト	閲覧/編集マウス

GRIK2、GluK2もしくはGluR6（glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2）は、ヒトではGRIK2遺伝子にコードされるタンパク質である^[5]^[6]^[7]。

機能

GRIK2遺伝子は、カイニン酸型グルタミン酸受容体のサブユニットをコードする。この受容体はシナプス可塑性（英語版）、学習、記憶と関係している可能性がある。また、網膜から視床下部への視覚情報の伝達に関与している可能性もある。この遺伝子にコードされるGluK2タンパク質の構造と機能は、RNA編集の影響を受ける。この遺伝子には選択的スプライシングによる転写バリアントが記載されている^[7]。

臨床的意義

GRIK2遺伝子のホモ接合型欠失・逆位変異は、非症候群性常染色体劣性遺伝性知的発達障害と関係している^[8]。

相互作用

GRIK2は次に挙げる因子と相互作用することが示されている。

RNA編集

いくつかの神経伝達物質受容体やイオンチャネルのpre-mRNAはADARの基質となり、アデニン（A）からイノシン（I）への編集を受ける。グルタミン酸受容体ではAMPA受容体サブユニットGluA2、GluA3、GluA4（英語版）、カイニン酸受容体サブユニットGluK1、GluK2が含まれる。グルタミン酸依存性イオンチャネルは各チャネル当たり4つのサブユニットから構成され、そのそれぞれがポアループ構造に寄与している。ポアループ構造はカリウムチャネルのもの（ヒトK_v1.1チャネルなど。K_v1.1のpre-mRNAもAからIへの編集を受ける）と類似している^[16]^[17]。

GluK2をコードするpre-mRNAに生じるRNA編集はアデニン（A）からイノシン（I）への編集であり^[18]、アミノ酸567番、571番、621番に対応する部分が編集される。621番はQ/R部位と呼ばれ、編集によってコドンがグルタミン（Q）をコードするCAGからアルギニン（R）をコードするCGGへ変化する。この部位は2番目の膜貫通領域（M2）のポアループ（Pループ）に位置する。Q/R部位の編集はGluA2やGluK1でも観察され、相同な位置にある^[19]。

GluK2はI/V部位（567番）、Y/C部位（571番）も編集され、これらは最初の膜貫通領域（M1）に位置している。編集によって、I/V部位ではイソロイシン（I）をコードするATTからバリン（V）をコードするGTTへ、Y/C部位ではチロシン（Y）をコードするTACからシステイン（C）をコードするTGCへ変化する^[20]。

RNAfoldプログラムにより、GluK2のpre-mRNAのQ/R部位周辺の推定二本鎖RNA形成領域が特定されている。この部位で編集が起こるためにはこの配列が必要である。転写産物の解析から、相補性配列（editing complementary sequence、ECS）は編集部位から約1.9 kb下流のイントロン12に位置することが観察されている^[19]。M1領域の編集部位のECSはまだ特定されていないが、編集部位からはかなり離れている可能性が高い^[21]。

調節

GluK2のpre-mRNAのQ/R部位の編集は、ラットの胚では0%、出生時には80%と発生過程で調節されていることが示されている。このことは、AMPA受容体サブユニットGluA2のpre-mRNAがほぼ100%編集されており、発生過程での調節を受けていないのとは異なっている^[20]。成体の脳のGluK2転写産物には、未編集型と編集型の双方とも多く存在する。灰白質では受容体の90%が編集を受けているが、白質では10%である。編集の頻度は胚では0%であるが、成体では85%にまで上昇する。

影響

GluK2のpre-mRNAは3カ所が編集され、各部位の編集はチャネルのカルシウムイオン透過性に影響を与える^[22]。

編集はチャネルの電気生理と関係している。Q/R部位の編集はGluK2では必要不可欠ではないと考えられている^[23]。未編集型のGluK2はシナプス可塑性を調節する機能を持つことが報告されている。編集型のGluK2はシナプス可塑性を阻害し、てんかん発作感受性を低下させると考えられている^[22]。Q/R部位を欠くマウスは長期増強の増加を示し、カイニン酸誘発性発作感受性が高まる。発作の回数はRNA編集の量との逆相関を示す。ヒトのGluK2のpre-mRNAの編集は発作時に増加し、適応機構となっていると考えられている^[24]^[25]。

3か所の編集の組み合わせによって、最大8種類の異なるアイソフォームが生じる。カルシウム透過性に対するQ/R部位の編集の影響は、I/V部位やY/C部位の編集に依存しているようである。M1の双方の部位（I/VとY/C）が編集されている場合、カルシウム透過性にはQ/R部位の編集が必要である。反対に、I/VとY/Cのいずれも編集を受けていない場合には、受容体はQ/R部位の編集とは無関係に高いカルシウム透過性を示す。これら2つのアイソフォームの組み合わせによって形成された受容体は、低いカルシウム透過性を示す^[22]。

Q/R部位の編集は、アラキドン酸やドコサヘキサエン酸などの膜脂肪酸によるチャネル阻害に影響を与える^[26]。編集型のアイソフォームのみからなるカイニン酸受容体はこれらの脂肪酸によって強力に阻害されるが、未編集型サブユニットが1分子加わるだけでこの作用は消失する^[26]。

マウスでのカイニン酸誘発発作は、ヒトの側頭葉てんかん（英語版）のモデルとして利用されている。GluK2のQ/R部位の編集を欠くマウスは発作感受性の増大を示すが、ヒトのてんかん患者の組織解析でこの部位の編集の低下がみられるわけではない^[23]^[27]^[28]^[29]。

出典

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000164418 - Ensembl, May 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000056073 - Ensembl, May 2017
^ Human PubMed Reference:
^ Mouse PubMed Reference:
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