La stagione 2011 dei San Francisco 49ers è stata la 62ª della franchigia nella National Football League e la prima con come capo-allenatore Jim Harbaugh. La squadra si riprese da una deludente stagione 2010, concludendo a otto la striscia di otto annate senza un record positivo. I Niners vinsero la propria division e si qualificarono ai playoff per la prima volta dal 2002. Il loro record di 13-3 fu il migliore dal 1997 e si guadagnarono la possibilità di accedere direttamente al secondo turno di playoff. Lì batterono i New Orleans Saints 36–32[1] qualificandosi per la prima finale di conference dal 1997, dove furono battuti dai New York Giants 20–17 ai supplementari[2].
Il primo ruolo è il principale mentre gli eventuali successivi indicano i ruoli secondari.
(IR) sta per Injured Reserve ed indica la lista ristretta per un solo giocatore infortunato che può tornare ad allenarsi dopo la settimana 6 e a rientrare in prima squadra dopo che questa ha giocato 8 partite.
(NF-Inj.) / (NF-Ill.) stanno rispettivamente per Non-Football Injured e Non-Football Illness ed indicano le liste dove viene inserito un giocatore che ha un infortunio o una malattia non dipendente dal football americano.
(PUP) sta per Physically Unable to Perform ed indica la lista dove viene inserito un giocatore mentre è in attesa di recuperare la condizione fisica. Nella stagione regolare dopo la sesta partita giocata dalla propria squadra, il giocatore ha tempo tre settimane per riprendere ad allenarsi, più tre settimane aggiuntive dal suo rientro agli allenamenti per rientrare in prima squadra.