La Malaysia ha partecipato ai Giochi della XXXI Olimpiade, che si sono svolti a Rio de Janeiro, Brasile, dal 5 al 21 agosto 2016, con una delegazione di 32 atleti impegnati in 10 discipline. Portabandiera alla cerimonia di apertura è stato Lee Chong Wei, già due volte medaglia d'argento nel badminton, alla sua quarta Olimpiade.
La rappresentativa malese, alla sua quindicesima partecipazione ai Giochi estivi, ha conquistato quattro medaglie d'argento e una di bronzo.