Il Gabon ha partecipato ai Giochi della XXXI Olimpiade, che si sono svolti a Rio de Janeiro, Brasile, dal 5 al 21 agosto 2016, con una delegazione di sei atleti, quattro uomini e due donne, impegnati in quattro discipline. La nazionale del Gabon è stata soggetta ad una drastica riduzione rispetto ai giochi di Londra 2012 dove aveva partecipato con 26 atleti.
Portabandiera alla cerimonia di apertura è stato il taekwondokaAnthony Obame, che quattro anni prima aveva conquistato la prima medaglia olimpica nella storia del suo paese. In questa edizione, alla decima partecipazione del Gabon ai Giochi, non sono state ottenute medaglie.