Il prototipo, (OK-BCA, c/n Ae 45.1) effettuò il suo primo volo il 21 luglio 1947. Un secondo prototipo, (OK-CCA, c/n Ae 45.2) volò il 12 marzo 1948. I due prototipi attraversarono senza problemi l’Europa a fini promozionali durante l'estate 1948 e il primo esemplare di serie uscì dalla fabbrica il 16 aprile 1949.
Impiego operativo
Dopo l'intenso utilizzo promozionale dei prototipi attraverso l'Europa, culminato nel raggiungimento di diversi record sportivi e la vittoria da parte del pilota collaudatore Jan Anderle con l'esemplare OK-DCL (49017) della corsa Norton Griffith in Gran Bretagna durante l'agosto 1949, l'aereo, ordinato in serie, riscosse successo anche in paesi al di fuori del blocco orientale, tra cui l'Italia e la Svizzera. In particolare, l'italiano Pier Paolo Brielli compì la prima traversata dell'Atlantico da parte di un aereo di costruzione cecoslovacca tra il 10 e l'11 agosto 1958, con un volo di 3.000 km dal Sud America a Dakar. Nel 1981 Jon Svensen compì il percorso inverso dall'Europa all'America.
Oltre all'utilizzo in patria, l'aereo venne quindi esportato in Cina, Francia, Germania Est, Italia, Polonia, Romania, Svizzera e Unione Sovietica, dove venne utilizzato in quantità per l'addestramento dei piloti. Un importante acquirente dell'Aero 45 fu l'Ungheria, dove venne denominato Kócsag (in lingua ungherese: airone). La produzione dell'aereo ebbe termine nel 1963.
Versioni
Aero 45 : Versione di base propulsa da due motori Walter Minor 4-III, 200 esemplari costruiti dalla Aero Vodochody fino al 1951.
Aero 45S Super Aero : Evoluzione del precedente, dotata tra le altre cose di nuova avionica, con 228 esemplari costruiti tra il 1954 e il 1959 dalla Let Kunovice, perché la Aero era troppo occupata nella produzione del caccia MiG-15.
Aero 145 : Questa designazione fu inizialmente riservata ad una versione più potente dell'Aero 45 con motore Walter6-III da 160 hp sviluppata nel 1948/49, poi ripresa per una evoluzione dell’Aero 45S dotata di motore con compressore Walter (ma costruito dalla Avia) M332 da 140 hp. 162 esemplari prodotti dalla Let Kunovice dal 1957 al 1963, soprattutto per le necessità dell'Aeroflot.
Aero 245 : Progetto con motore Walter 6-III da 160 hp, mai entrato in produzione.
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