במאה ה-21 החל הרב זינגר להדריך חבורות בשם "אז נדברו" העוסקות בעבודה עצמית ובתפילה. חבורות אלה שואפות להעתיק את מרכז הלמידה משיעורים פרונטליים ללימודדיאלוגי. הן נפגשות יחד מדי חודש לתפילת ראש חודש חגיגית.
בשנת 1984 הקים את ישיבת מקור חיים יחד עם הרב עדין שטיינזלץ ועד היום מכהן כראש הישיבה.
הרב זינגר נשוי לאיריס ואב לעשרה ילדים. בנו שלמה נשוי לשירה ליניק, בתה של הזמרת אתי אנקרי.
שיטתו החינוכית
הרב דוגל בדיבור מלב אל לב אל התלמידים, דבר הבא לידי ביטוי בכמה תחומים. הרב משתף את התלמידים בהחלטות הנעשות בישיבה. אין זה אומר שהתלמידים מקבלים את ההחלטות, אלא שהצוות מקשיב ושומע את דעת התלמידים לפני קבלת החלטות. בנוסף, הרב מאמין בדיבור פתוח לא רק בין הצוות לתלמידים אלא גם בין התלמידים עצמם, דבר הנעשה במסגרת "חבורות" ו"בליץ" – אסיפות של מספר תלמידים ללימוד, שיח וניגון, ללא ציניות, לרוב בהנחיית איש צוות.
הרב תומך ומעודד את התלמידים ללמוד שנים רבות בישיבה, לא פעם אחת הרב הביע צער על כך שבישיבות ההסדר לא לומדים תורה שנים ארוכות. גישה זו מתבטאת בכך שעל אף שבישיבה לומדים לבחינות הבגרות ברמה גבוהה, אין זה מודגש, והשיח על לימוד התורה וחשיבותו מודגש יותר.
הרב מעודד שיח פתוח בחברה הישראלית, במטרה למצוא את המאחד ולהתגבר על המפריד. תלמידי השמינית בישיבה יוצאים למסע באורך כשבועיים, להכרת החברה הישראלית. המסע נקרא "מסע יהונתן" לזכר תלמיד הישיבה יהונתן צוקרמן שנהרג בתאונת דרכים.
לשיטת הרב זינגר, לימוד אמונה צריך להיעשות בדרך של חיזוק "שריר" האמון ולא שריר השכל (על אף שגם דרכו אפשר להגיע לאמונה), והוא קרוב לשיטות של גדולי החסידות ובמיוחד של רבי נחמן מברסלב, ובעידן המודרני – הרב שטיינזלץ והרב שג"ר. השיטות של השניים האחרונים לרוב לא נלמדות בישיבה באופן רשמי בשיעורי הרב, על אף שרוח תורתם נשמעת בבירור בישיבה.