De 1921 à 1925, Augusta a étudié à l'université Masaryk de Brno. Entre 1933 et 1968, il a occupé le poste de conférencier, professeur et doyen à l'université Charles de Prague. En plus de ses ouvrages scientifiques (environ 120 publications), Augusta a rédigé une vingtaine d'ouvrages de vulgarisation sur la paléontologie destinés principalement à la jeunesse. Son nom est surtout connu pour son association avec le peintre tchèque Zdeněk Burian pour les reconstitutions de la flore et de la faune fossile.