La famille descend du clan Bogátradvány(en) qui remonte au XIIIe siècle. Une branche de ce clan prendra le nom d'un domaine, Rákóc. Appartenant à la moyenne noblesse hongroise (középnemeseg), la famille Rákóczi prend de l'importance à partir du XVIe siècle, époque à laquelle sa filiation est continue.
La branche princière s'éteint en 1735 avec François II Rákóczi. La branche non titrée s'éteint quant à elle en 1754 avec András Rákóczi.
La famille Rákóczi était avec les Esterházy et les Thököly l'une des trois plus riches et importantes familles du royaume de Hongrie. En 1660, elle possédait une centaine de grands domaines qui représentaient plus de 100 000 sujets. Elle était à cette époque considérée à l'égal d'une famille souveraine par la diplomatie française.