Le besoin d'un nouveau cimetière pour la ville de Santander date de l'année 1832.
Le nouveau cimetière municipal de Ciriego est ainsi projeté par l'architecte municipal Casimiro Pérez de la Riva en 1881, et inauguré le 3 septembre 1893, sous la direction de Joaquín Ruiz Sierra[3].
Guerre d'Espagne
Pendant la Guerre civile, le cimetière est le lieu d'exécutions massives de prisonniers républicains originaires de diverses prisons et de camps de concentration franquistes, en particulier en provenance du séminaire de Monte Corbán. Entre 1937 et 1948, au moins 836 victimes de la répression franquiste y sont inhumées, en très grande majorité dans des fosses communes[4]. 778 d'entre elles ont été inscrites sur le registre du cimetière par Tomás Soto Pidal, chapelain et administrateur de l'établissement[5].