Pour autant, le monument connait des difficultés de financement et les plans initiaux de von Klenze sont revus par Lýsandros Kaftanzóglou en 1858. L'architecte grec tire notamment un trait sur la construction d'un clocher à l'est et réduit les dimensions de l'édifice. Bien que non achevée, la cathédrale est ouverte en 1865[3]. En 1869, l'empereur François-Joseph Ier fait don de deux chaires en marbre situées de chaque côté du chœur[4]. L'ensemble du chœur, de l'autel et du porche est finalement achevé en 1891[3].
La cathédrale a reçu le rang de basilique mineure en 1877[5]. Elle a connu une première restauration en 1960, suivie d'une importante campagne de travaux entre 1992 et 1998[3].
↑(en) Richard Clogg, Minorities in Greece: Aspects of a Plural Society, Londres, Hurst Publishers, , 203 p. (ISBN978-1-85065-706-4, lire en ligne), p. 36 et 37.
↑(en) Alexander Tzonis et Alcestis P. Rodi, Greece: Modern Architectures in History, Londres, Reaktion Books, , 272 p. (ISBN978-1-86189-937-8, lire en ligne), p. 23.
(el) Konstantínos Bíris(en), Αι Αθήναι: Από τον 19ον εις τον 20ον αιώνα (1830–1966) [« Athènes : du XIXe au XXe siècle (1830–1966) »], Athènes, Mélissa, (1re éd. 1966), 452 p. (ISBN960-204-026-2).
(el) Efgénios Dalézios(el), Ο εν Αθήναις καθεδρικός ναός του Αγίου Διονυσίου του Αρεοπαγίτου (1865-1965): μετά συντόμου ιστορίας των καθολικών ενοριών της ηπειρωτικής Ελλάδος (1830-1965) [« La cathédrale Saint-Denys-l'Aréopagite à Athènes (1865–1965) : après une brève histoire des paroisses catholiques de la Grèce continentale (1830–1965) »], Athènes, , 117 p.