Ο θεσμός του κυπέλλου, αποτελεί ταυτόχρονα την πρώτη φάση του Κυπέλλου Ερασιτεχνών της ΕΠΟ. Η ομάδα που ανακηρύσσεται κυπελλούχος ΕΠΣ Καβάλας, αποκτά το δικαίωμα συμμετοχής στο Κύπελλο Ερασιτεχνών.[1]
Η δομή του πρωταθλήματος της Ε.Π.Σ. Καβάλας είναι η εξής:[2]
Α΄ Κατηγορία
Β΄ Κατηγορία
1ος Όμιλος
2ος Όμιλος
Γ΄ Κατηγορία
Α΄ Κατηγορία
Σε έναν όμιλο με 16 ομάδες διεξήχθη το πρωτάθλημα της Α΄ Κατηγορίας. Πρωταθλητής αναδείχθηκε ο Ηρακλής Ποταμουδίων Καβάλας που δεν καταφερε να προβιβαστεί στη Γ΄ Εθνική. Καθώς είχε προβλεφθεί για την περίοδο 2016-17 η Α΄ κατηγορία να διεξαχθεί με 14 ομάδες[3] και λόγω του υποβιβασμού από τη Γ΄ Εθνική του Βυζαντίου Κοκκινοχώματος, οι 5 τελευταίες ομάδες, Αναγέννηση Λιμεναρίων, Βύρων Καβάλας, Αετός Ερατεινού, Ολυμπιακός Καβάλας και Άρης Ακροποτάμου υποβιβάστηκαν στη Β΄ Κατηγορία.
↑Ο Ολυμπιακός Καβάλας είχε αφαίρεση -6 βαθμών και αποβλήθηκε από το πρωτάθλημα.
↑Ο Άρης Ακροποτάμου είχε αφαίρεση -6 βαθμών και αποβλήθηκε από το πρωτάθλημα.
Β΄ Κατηγορία
Σε δυο ομίλους των 13 ομάδων διεξήχθη η Β΄ Κατηγορία. Οι πρωταθλήτριες των 2 ομίλων κέρδισαν την άνοδο στην Α΄ ΕΠΣΚ για την περίοδο 2016-17. Οι τελευταίες κάθε ομίλου υποβιβάστηκαν, όπως και η ηττημένη αγώνα κατάταξης μεταξύ των προτελευταίων (12η θέση) κάθε ομίλου. Η πρόβλεψη της προκήρυξης[3] ήταν να διεξαχθεί το πρωτάθλημα της επόμενης περιόδου με 28 συνολικά ομάδες.
1ος Όμιλος
Προβιβάστηκε στην Α΄ Κατηγορία ο Εθνικός Ν. Καρυάς, ο Ατρόμητος Λεκάνης οδηγήθηκε σε αγώνα μπαράζ υποβιβασμού, ενώ υποβιβάστηκε στη Γ΄ Κατηγορία ο Πανιώνιος Ξεριάς.
Προβιβάστηκε στην Α΄ Κατηγορία ο Άρης Ζυγού, ο Παγγαϊκός Παλαιοχωρίου οδηγήθηκε σε αγώνα μπαράζ υποβιβασμού, ενώ υποβιβάστηκε στη Γ΄ Κατηγορία ο Μέγας Αλέξανδρος Φιλίππων.
Με τη συμμετοχή 15 ομάδων σε έναν όμιλο διεξήχθη το πρωτάθλημα της Γ΄ Κατηγορίας. Η πρωταθλήτρια ομάδα του Ποσειδώνα Καβάλας, ο Ποντιακός Ποντολίβαδου και ο Μαίανδρος Γέροντα εξασφάλισαν την άνοδο τους στην Β΄ Κατηγορία.