Ο Δήμος Κομοτηνής αποτελείται από τρεις «δημοτικές ενότητες», οι οποίες αντιστοιχούν στους τρεις δήμους από τους οποίους προήλθε. Κάθε δημοτική ενότητα διαιρείται σε «τοπικές κοινότητες», οι οποίες αντιστοιχούν στα πρώην δημοτικά διαμερίσματα των καταργηθέντων ΟΤΑ. Οι σημερινές τοπικές κοινότητες του Δήμου υπήρξαν αυτόνομες κοινότητες και δήμοι, πριν την εφαρμογή του Προγράμματος Καποδίστριας.
Δημοτική Ενότητα Κομοτηνής
Η έκτασή της είναι 288,5 τ.χλμ και ο πληθυσμός της 52.659 κάτοικοι, σύμφωνα με την Απογραφή του 2001. Η Κομοτηνή είναι και η έδρα του δήμου. Οι κοινότητες από τις οποίες αποτελείται αντιστοιχούν στα 12 δημοτικά διαμερίσματα του προϋπάρχοντος Δήμου Κομοτηνής, που με τη σειρά τους αντιστοιχούσαν σε 12 κοινότητες και οικισμούς που συνενώθηκαν με το Πρόγραμμα Καποδίστριας.[2]
Έχει συνολικό πληθυσμό 4.418 κατοίκους, σύμφωνα με την απογραφή του 2001 και η έκτασή της είναι 51,1 τ.χλμ. Ο προηγούμενος δήμος Αιγείρου είχε δημιουργηθεί από την συνένωση των κοινοτήτων Αιγείρου, Νέας Καλλίστης, Μέσης και Φαναρίου.[3] Έδρα του πρώην δήμου ήταν η Αίγειρος
Έχει συνολικό πληθυσμό 3497 κατοίκους, σύμφωνα με την απογραφή του 2001. Έδρα του πρώην δήμου ήταν το Νέο Σιδηροχώρι. Είχε δημιουργηθεί από την συνένωση των κοινοτήτων Νέου Σιδηροχωρίου και Αγιών Θεοδώρων και των οικισμών Παγούρια και Μέγα Δουκάτο από τις κοινότητες Μέσης και Κοσμίου αντίστοιχα.[4]