Die Kirche wurde mit Bruchsteinmauerwerk das auf einem Betonfundament ruht unter der Bauführung von J. Zehnder zwischen 1884 und 1886 erstellt.[1] Es war für Basel der erste katholische Kirchenbau seit der Reformation.
Die katholische Kirchgemeinde war ab 1798 ursprünglich in der Clarakirche untergebracht, aber trotz einer Erweiterung dieser Kirche konnte sie nicht mehr alle Gläubigen aufnehmen und man suchte daher nach einem Ersatz.
Als Architekt für den Neubau konnte der bekannte Basler BauingenieurPaul Reber gewonnen werden, ein typischer Vertreter des ausgehenden Historismus, der protestantischer wie katholische Kirchen in jeder beliebigen Stilrichtung zu bauen verstand.[2] Die neuromanische Kirche wurde als grosse, dreischiffige, flachgedeckte Säulenbasilika mit Querhaus konzipiert, wobei das Querschiff wegen Bauabständen nicht sehr ausgeprägt werden konnte. Die Kirche fasste 1300 Sitzplätze. Im Innern dominieren die vier monolithischen Rundsäulen aus Veroneser Marmor das Bild. Die reiche Ausstattung war neobyzantinisch ausgelegt. Aus finanziellen Gründen war zunächst der Bau des Turms nur vorgesehen.[3]
1954 erachtete man eine Renovation und Modernisierung der Kirche als unumgänglich. Ausführender Architekt war Fritz Metzger. Das Ergebnis war radikal: ein von jeglichen neobyzantinischen Ausstattungselemente entkleideter Raum, der einschliesslich der Marmorsäulen weiss gestrichen wurde. Zudem wurden die Fenster mit neuen Glasgemälden von Coghuf ausstattete.[2][3]
Nach einem Brand im Jahr 1983 wurde die Kirche durch H. P. Baur und Fritz Kettner erneut umfassend restauriert. Die Bilder der Kreuzwegstationen aus der ursprünglichen Kirche wurden in einem Keller entdeckt und wieder angebracht.[3]
Orgel
Bereits 1886 wurde die erste Orgel eingeweiht. Das Instrument wurde von den Gebrüdern Klingler (Rorschach) erbaut und hatte 34 Register. 1932 wurde das Instrument neu erbaut, und auf 39 Register erweitert, 1958 auf 42 Register erweitert. Die heutige Orgel wurde von dem Orgelbauer Hans Füglister (Grimisuat) erbaut und 1989 eingeweiht.[4]