Малко е известно за живота на Бенедикт III преди понтификата. Живял и учил в Рим.
След смъртта на Лотар I папа Бенедикт III активно се намесва в конфликта между синовете му – бъдещият Лотар II, Лудвиг II и Карл.
По време на неговия понтификат кралят на Уесекс Етелвулф и синът му, бъдещият Алфред Велики, посещават Рим.
Легендарната (и вероятно недействителна личност) папеса Йоана според хрониката на Мартин Опавски е заемала папския престол между управлението на Лъв IV и Бенедикт III.