في 12 يناير 2020، أكدت منظمة الصحة العالمية (WHO) أن فيروس تاجي جديد كان سببًا لمرض تنفسي لمجموعة من الأشخاص في مدينة ووهان، مقاطعة خوبي، الصين، والذين كانوا قد لفتوا انتباه منظمة الصحة العالمية في البداية في 31 ديسمبر 2019. رُبطت هذه المجموعة في البداية بسوق هوانان للمأكولات البحرية بالجملة في مدينة ووهان. ومع ذلك، فإن بعض الحالات الأولى التي أظهرت نتائج مختبرية لا صلة لها بالسوق، فمصدر الوباء غير معروف.[1][2]
في 14 مارس، أُعلن عن الحالة الأولى للبلاد، وهي امرأة تبلغ من العمر 42 عامًا عادت إلى غينيا الاستوائية من مدريد.
في 22 مارس أعلنت الدولة حالة من القلق، كانت ضرورية لتسهيل تعبئة الموارد الاقتصادية والمادية اللازمة لوقف انتشار الفيروس التاجي. كما أنشئ صندوق طوارئ خاص للحد من الفيروس.[7]
حتى 24 مارس، كانت هناك 9 حالات في البلاد، وكانت جميعها مستوردة. لم تكن هناك حالات مؤكدة لانتشار المجتمع في البلاد في ذلك الوقت.[8]
وبحلول 5 أبريل 2020 ، أكدت منظمة الصحة العالمية 16 حالة إصابة بـ كوفيد-19 في غينيا الاستوائية.[9]