西拉雅語音系（Siraya phonology）為西拉雅語之音系。而其音系之音位大都使用適當的Unicode符號來標示。在台灣南島語的書寫系統的訂定上，元輔音之音系表原則上都是先「發音部位」(橫列)、後「發音方法」(縱列)、再考量「清濁音」，來訂定其音系之音位架構。^[1]

西拉雅語全部使用 26個拉丁字母(A～Z)。

西拉雅語音分元音與輔音。^[2]

根據前中研院史語所副所長李壬癸博士與日本語言學家土田茲研究，西拉雅語、大滿語及馬卡道語等南部平埔語言至少有四種音韻演變的差異及一種構詞上的差異^[3][4]：

1. 西拉雅語和馬卡道語的 r 對應大滿語的 h 或消失，如西拉雅語的 turu（三）對應大滿語的 tuhu，或西拉雅語的 rima（五）對應大滿語的 hima。
2. 西拉雅語和大滿語的 l 對應馬卡道語的 n、l 或 r，如西拉雅語的 wali（牙齒）對應馬卡道語的 wari。
3. 西拉雅語的 s 對應大滿語的 r 或 d，如西拉雅語的 sa（和）對應大滿語的 ra 或 da，或西拉雅語的 raos（西邊）對應大滿語的 raur。
4. 西拉雅語在元音之間的舌根音 k 和 g 在大滿語已脫落，如西拉雅語的 ako-saij（沒有）對應大滿語的 au-saij，或西拉雅語的 dagogh（價錢）對應大滿語的 daoh。

構詞上，西拉雅語表示「未來」的動詞後綴為 -ali、-ili（新港社）或 -ati、-ili（卓猴社），而大滿語是 -ah（灣裡社、麻豆社），馬卡道語則是與西拉雅語同源的 -ani（下淡水社）。

整理如下：

由各地語料上的差異規律，李壬癸發現麻豆社與灣裡社有相同的音韻與構詞變化，應同屬大滿語，而非西拉雅語。

李壬癸推論南部平原西拉雅語、大滿語及馬卡道語約在 3 千多年前就開始分化，只是17 世紀荷蘭人據臺後，採用臺南新港社西拉雅語作為通用語，造成各族群間語言逐漸同化。

其他字彙上的差異如下：

• 註1. Het Standaard Siraya is waarschijnlijk gelijk aan het Siraya-dialect.（荷兰文）中文解釋：標準西拉雅語也可能跟西拉雅方言是相同的。
• 註2. 西拉雅語“〈attaing ta solat〉：訂立契約(make a contract)。”
• 註3. 另西拉雅語文書契約採用大量的外來語拼音文字如：閩南語、荷蘭語，及汉语等。

• 西拉雅語語法