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《被子植物APG II分类法（修订版）》是由被子植物种系发生学组（APG）于2003年發表的，基于1998年所發表的《被子植物APG分类法》之修訂版，在吸收了全世界大部分植物分类学家的意见，2009年發表《被子植物APG III分类法》，2016年更新到《APG IV》。目前已经在现代的参考文献中占很重要的地位。
基本分支
主要的大分類群之建立，由於未有確定的證據，目以上分類群多採用一般性的名稱 (非學名)作為暫時性的分類。基本分支如下：
分支
注: "+ ..." 是一种建议选择，可以合并也可以单独分为一科。
尚无定论的属和科
如果可以列为单属科的属，将科名也同时列出：
- Aneulophus Benth.
- 离花科 Apodanthaceae van Tieghem ex Takhtajan in Takhtajan （1997年）共三属
- 美洲簇花草属 Bdallophyton Eichl.
- 蛇菰科 Balanophoraceae Rich. （1822年）
- Centroplacus Pierre
- 锁阳属 Cynomorium L. （锁阳科 Cynomoriaceae Lindl. 1833年）
- 簇花草属 Cytinus L. （簇花草科 Cytinaceae A.Rich. 1824年）
- 十齿花属 Dipentodon Dunn （十齿花科 Dipentodontaceae Merr. (1941年)
- Gumillea Ruiz & Pav.
- 单柱花属 Hoplestigma Pierre （单柱花科 Hoplestigmataceae Engl. & Gilg 1924年）
- Leptaulus Benth.
- 毛丝花属 Medusandra Brenan （毛丝花科 Medusandraceae Brenan 1952年）
- 管花木属 Metteniusa H.Karst. （管花木科 Metteniusaceae H.Karst. ex Schnizl. 1860年-1870年）
- 帽蕊草属 Mitrastema Makino （帽蕊草科 Mitrastemonaceae Makino 1911年）
- 托叶假樟属 Pottingeria Prain （托叶假樟科 Pottingeriaceae (Engl.) Takht. 1987年）
- 大花草科 Rafflesiaceae Dumort. （1829年）共三属
- 非洲盘树属 Soyauxia Oliv.
- Trichostephanus Gilg
參考文獻
