Під час дев'ятої експедиції були здійснені роботи з обслуговування і розвантаження ТКГ «Прогрес» («Прогрес М1-11»: розстикування; «Прогрес М-49»: розвантаження, розстикування; «Прогрес М-50»: розвантаження) і «Союз» («Союз ТМА-3»: розстикування; «ТМА-4»: стикування, розвантаження). Були проведені наукові дослідження та експерименти за російською та американською програмами. Під час дев'ятої основної експедиції були здійснені експедиції відвідин ЕП-6 і ЕП-7. По завершенні станція була передана екіпажу 10-ї основної експедиції.
Екіпаж
21 лютого2002 року рішенням Багатосторонньої комісії з екіпажів (MCOP — від англ.Multiteral Crew Operation Panel) були сформовані два екіпажі (основний і дублюючий) у таких складах[1]:
У листопаді 2003 року спільним рішенням російської і американської сторін два екіпажі для підготовки до польоту на МКС за програмою 9-ї основної експедиції були переформовані[2]:
Для цих складів навіть була розпочата підготовка у РГНІІ ЦПК[3].
Але у січні 2004 року у російських лікарів виникли претензії до здоров'я Вільяма МакАртура, внаслідок чого він був виведений з екіпажу, і на його місце 13 січня 2004 року було призначено Лерой Чиао, який почав готуватися в екіпажі з Токарєвим. У лютому було вирішено замінити основний екіпаж, повернувши Чиао до складу дублюючого[4].
24 червня з 21:57 по 22:10 UTC — загальна тривалість 14 хвилин 22 секунд. Вихід було завершено достроково через втрату тиску у кисневому балоні Фінка.
29 червня з 21:19 до 2:59 30 червня — 5 годин 14 хвилин. Основним завданням було обслуговування гіроскопа МКС.
3 серпня з 6:58 по 11:28 UTC — 4 години 30 хвилин. Під час третього виходу Геннадієм Падалкою та Едвардом Фінком були встановлені дві антени і замінені три лазерні відбивачі.
3 вересня, з 16:43 по 22:04 UTC — 5 годин 20 хвилин[7]. Були встановлені стикувальні антени для «ATV».