PX domen

PX domen NADH oksidaze (p40phox) vezane za lipid
Identifikatori
SimbolPX
PfamPF00787
InterProIPR001683
SMARTPX
PROSITEPDOC50195
SCOP1h6h
SUPERFAMILY1h6h
OPM superfamilija60
OPM protein1xte
CDDcd06093

PX domen je strukturni domen koji vezuje fosfoinozitid i učestvuje u sortiranju proteina ka ćelijskoj membrani.

Ovaj domen je prvo bio otkriven u P40phox i p47phox domenima NADPH oksidaza (phox označava fagocitnu oksidazu).[1][2] On je takođe identifikovan u mnogim drugim proteinima koji učestvuju u membranskoj razmeni, uključujući neksine, fosfolipazu D, i fosfoinozitid-3-kinaze.

PX domen je strukturno konzerviran kod eukariota, mada aminokiselinske sekvence imaju malu sličnost.[3] PX domeni prvenstveno formiraju interakcije sa PtdIns(3)P lipidima.[4][5] Neki od njih se vezuju za fosfatidnu kiselinu, PtdIns(3,4)P2, PtdIns(3,5)P2, PtdIns(4,5)P2, i PtdIns(3,4,5)P3. PX-domen takođe može da formira interakcije sa drugim domenima i proteinima.

Ljudski proteini koji sadrže ovaj domen

Sortirajući neksini sadrže ovaj domen. Drugi primeri su:

Reference

  1. ^ Ponting CP (1996). „Novel domains in NADPH oxidase subunits, sorting nexins, and PtdIns 3-kinases: binding partners of SH3 domains?”. Protein Sci. 5 (11): 2353—7. PMC 2143296 Слободан приступ. PMID 8931154. doi:10.1002/pro.5560051122. 
  2. ^ Wishart MJ, Taylor GS, Dixon JE (2001). „Phoxy lipids: revealing PX domains as phosphoinositide binding modules”. Cell. 105 (7): 817—20. PMID 11439176. doi:10.1016/S0092-8674(01)00414-7. 
  3. ^ Hiroaki H, Ago T, Ito T, Sumimoto H, Kohda D (2001). „Solution structure of the PX domain, a target of the SH3 domain”. Nat. Struct. Biol. 8 (6): 526—30. PMID 11373621. doi:10.1038/88591. 
  4. ^ Karathanassis D, Stahelin RV, Bravo J, Perisic O, Pacold CM, Cho W, Williams RL (2002). „Binding of the PX domain of p47phox to phosphatidylinositol 3,4-bisphosphate and phosphatidic acid is masked by an intramolecular interaction”. EMBO J. 21 (19): 5057—68. PMC 129041 Слободан приступ. PMID 12356722. doi:10.1093/emboj/cdf519. 
  5. ^ Ago T, Kuribayashi F, Hiroaki H, Takeya R, Ito T, Kohda D, Sumimoto H (2003). „Phosphorylation of p47phox directs phox homology domain from SH3 domain toward phosphoinositides, leading to phagocyte NADPH oxidase activation”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100 (8): 4474—9. PMC 153580 Слободан приступ. PMID 12672956. doi:10.1073/pnas.0735712100.