FYVE domen
U molekularnoj biologiji FYVE cinkov prst domen je dobio ime po grupi od četiri proteina bogatih cisteinom: Fab 1 (kvaščani ortolog proteina PIKfyve), YOTB, Vac 1 (transportni protein vezikula), i EEA1, kod kojih je nađen. FYVE domeni vezuju fosfatidilinozitol 3-fosfat,[2] na način koji je zavistan od od koordinacije metalnih jona i od baznih aminokiselina. FYVE domen se umeće u ćelijske membrane na način koji je zavistan od pH vrednosti.[3] Ovaj domen učestvuje u vakuolarnom sortiranju proteina i funkcionisanju endozoma.[4]
Struktura
FYVE domen se sastoji od dve male beta ukosnice (ili cinkova zglavka) čemu sledi alfa heliks.[5] FYVE prst vezuje dva jona cinka. On ima osam pozicija koje potencijalno mogu da sadrže cink, i karakterističan je po tome što ima bazne aminokiseline oko cisteina. Mnogi članovi ove familije takođe sadrže dva histidina u motivu:
R+HHC+XCG, gde + označava naelektrisane ostatke, a X bilo koji ostatak
FYVE prst je strukturno sličan sa RING domenom i PHD prstom.
Primeri
Sledeći ljudski proteini sadrže FYVE domen:
- ANKFY1, EEA1 FGD1, FGD2, FGD3, FGD4, FGD5, FGD6, FYCO1, HGS MTMR3, MTMR4, PIKFYVE, PLEKHF1, PLEKHF2
- RUFY1, RUFY2, WDF3, WDFY1, WDFY2, WDFY3, ZFYVE1, ZFYVE16, ZFYVE19, ZFYVE20, ZFYVE21, ZFYVE26, ZFYVE27, ZFYVE28, ZFYVE9
Reference
Literatura
- Stenmark H, Aasland R, Toh BH, D'Arrigo A (1996). „Endosomal localization of the autoantigen EEA1 is mediated by a zinc-binding FYVE finger”. J. Biol. Chem. 271 (39): 24048—54. PMID 8798641.
- Stenmark H, Aasland R (1999). „FYVE-finger proteins--effectors of an inositol lipid”. J. Cell. Sci. 112 (Pt 23): 4175—83. PMID 10564636.
|
|