Свеучилиште је 19. новембра1874. отворио банИван Мажуранић. Прва два споменута факултета већ су била практично уређена као четворогодишње студије, Мудрословни факултет је почео рад уписом студената прве године, док је отварање Лијечничког факултета остављено за касније када се осигурају средства за његово дјеловање. Тако је оснивање првог и дотад јединог медицинског факултета у Хрватској морало сачекати више од 40 година од оснивања модерног Хрватског свеучилишта у Загребу.
Најзначајнији догађај за Медицински факултет у Загребу збио се 17. децембра1917. када је Земаљска влада, односно Одјељење за богоштовље и наставу одредио сазив прве конференције наставника везана за предавања за први семестар наставе на Медицинском факултету у Загребу. Овај се датум данас слави као Дан Медицинског факултета.
Медицински факултет у Загребу службено је почео с радом 12. јануара1918. када је др Драго Перовић одржао у аулиСвеучилишта прво предавање под насловом О смјеру наставног и знанственог рада у анатомији.
Како се Медицински факултет развијао и ширио своје дјелатности јавила се тежња за обновом и изградњом нових простора на Шалати. Изградњом новог објекта на Шалати, Медицински факултет је отворио нови простор за службе Деканата, нове предаваонице, студентске просторије, ресторан за студенте, читаоницу, а добар дио књижничког фонда из старе преселио је у нову књижницу. Службено отварање новог објекта збило се на Дан младости25. маја1981. године у поводу 40 годишњице устанка народа Југославије када је пред новообновљеном зградом Медицинскога факултета откривена скулптура „Дјевојка с књигом” академског кипараФрана Кршинића симболизирајући стару поруку у новом окружењу свима који долазе на медицину и желе студирати.