Tokom cele godine prekriveno je naslagama leda čija moćnost prelazi 15 metara (najveće na Arktiku). Prosečna dubina varira između 100 i 300 metara. Njegove vode i led su preko Robesonovog moreuza povezani sa Naresovim prolazom na jugu (moreuzom Baffinovog zaliva).
Lincolnovo more je trenutno predmet graničnog spora između Kanade i Danske (odnosno Grenlanda). Sporna je dužina morske granice od oko 200 km oko malenog ostrvca Hans na koji obe države polažu pravo.