Integraza

Integrazni domen vezivanja cinka

Struktura n-terminalnog zn vezujućeg domena hiv-1 integraze (e forme), nmr, 38 struktura
Identifikatori
Simbol	Integrase_Zn
Pfam	PF02022
InterPro	IPR003308
SCOP	1wjb
Superfamilija	1wjb
Dostupne PDB strukture: Pfam structures PDB RCSB PDB; PDBe PDBsum strukturni pregled

Sržni domen integraze

Kristalna struktura rsv, dvodomenske integraze
Identifikatori
Simbol	rve
Pfam	PF00665
Pfam klan	CL0219
InterPro	IPR001584
SCOP	2itg
Superfamilija	2itg
Dostupne PDB strukture: Pfam structures PDB RCSB PDB; PDBe PDBsum strukturni pregled

Integrazni domen vezivanja DNK

kristalna struktura rsv dvodomenske integraze
Identifikatori
Simbol	IN_DBD_C
Pfam	PF00552
InterPro	IPR001037
SCOP	1ihw
Superfamilija	1ihw
Dostupne PDB strukture: Pfam structures PDB RCSB PDB; PDBe PDBsum strukturni pregled

Retrovirusna integraze (IN) enzim je koji proizvode retrovirusi (poput HIVa), koji omogućavaju da se njihov genetički materijal integriše u DNK inficirane ćelije. Retrovirusni IN enzimi se razlikuju od fagnih integraza, poput λ fagne integraze (Int).

IN je ključna komponenta retrovirusnog preintegracionog kompleksa (PIC).

Svi retrovirusni IN proteini sadrže tri kanonička domena, povezana fleksibilnim sponama:

• N-terminusni HH-CC zink-vezujući domen (tri-heliksni svežanj je stabilizovan koordinacijom Zn(II) katjona)
• katalotičko sržni domen (RNazaH savijanje)
• C-terminusni DNK-vezujući domen (SH3 motiv)^[1]

Kristalne i NMR strukture individualnih domena i 2-domenski konstrakti integraza iz HIV-1, HIV-2, SIV, i Rous Sarcoma Virusa (RSV) su poznati. Prva struktura je određena 1994.

Biohemijski i strukturni podaci sugerišu da retrovirusne integraze deluju kao tetrameri (dimeri dimera). Sva tri domena su važna za multimerizaciju i vezivanje viralne DNK. Tokom ranih 2010, rešene su kristalne strukture IN iz prototipnog PFV virusa sklopljene na viralnim DNK krajevima.^[2]

• Rekombinazna tehnologija specifična za mesto

• MeSH Integrases