Devido aos seus pais serem aparentados, foram os filhos que acabaram por ser as vítimas de uma endogamiadinástica. Cinco dos seus irmãos não sobreviveram aos primeiros anos. O seu irmão Fernando, mais tarde Fernando I da Áustria, nasceu com hidrocefalia, era esquizofrênico e toda a sua vida dependerá de empregados e de um consultor. A sua irmã, Maria Ana, era débil mental e estava num estado vegetativo, foi sempre supervisionada por uma enfermeira até ao dia da sua morte num quarto fechado. Os outros irmãos, Maria Luísa, a esposa de Napoleão Bonaparte, e Francisco Carlos, o pai do falecido Imperador Francisco José I, sofriam de grandes variações de humor. A exceção foi a irmã mais velha, e mais tarde Imperatriz do Brasil, Maria Leopoldina, que foi abençoada com elevada inteligência, curiosidade, agilidade mental e talentos artísticos acima da média.
Quanto a Maria Clementina, ela sofria de uma saúde muito ruim durante toda a vida, por isso passou longos períodos em sua terra natal, já casada. Embora levar em conta sua longevidade pode ser que a saúde era um pretexto e, de fato, o motivo de sua permanência em Viena foi a má relação entre os cônjuges. Obtendo assim uma separação virtual momentânea do marido.
Luís Carlos (1824-1824), morreu antes de completar um mês;
Filha natimorta (1829).
A infidelidade de Leopoldo levou Maria Clementina a tomar uma atitude, aquando da relação amorosa que ele mantinha com a bailarina Fanny Elßler, filha de uma lavadeira e do compositor Joseph Haydn, com quem teve um filho ilegítimo.
Após a morte do seu marido em 1851, ela foi bem recebida no castelo do seu genro, Henrique d'Orleães, em França. Mesmo após a morte de sua filha, Maria Carolina († 1869), continuou a residir neste castelo.
Morte
Maria Clementina morreu em 3 de setembro de 1881 no Castelo de Chantilly na França, a casa de seu genro viúvo, o Henrique. Ela tinha oitenta e três anos; todos os seus descendentes morreram antes dela. Ela foi enterrada na Basílica de Santa Clara, em Nápoles.
Títulos e honrarias
Títulos e estilos
1 de março de 1798 – 28 de julho de 1816: Sua Alteza Imperial e Real, a Arquiduquesa Maria Clementina da Áustria, Princesa da Hungria, Croácia, Boêmia e Lombardia-Vêneto
28 de julho de 1816 – 10 de março de 1851: Sua Alteza Imperial e Real, a Princesa de Salerno
10 março de 1851 – 3 de setembro de 1881: Sua Alteza Imperial e Real, a Princesa-Viúva de Salerno
Maria Antónia, Eleitora da Baviera·Arquiduquesa Maria Ana·Arquiduquesa Cristina·Maria Isabel da Áustria (1680)·Arquiduquesa Maria Isabel·Maria Ana, Rainha de Portugal·Arquiduquesa Maria Teresa da Áustria (1684)·Arquiduquesa Maria Teresa·Arquiduquesa Maria Josefa·Maria Madalena de Áustria·Arquiduquesa Maria Madalena·Arquiduquesa Maria Margarida
Isabel Maria, Princesa de Windisch-Graetz·Helena, Duquesa Filipe de Württemberg**·Rosa, Duquesa Württemberg**·Arquiduquesa Dolores**·Maria Imaculada, Nobile Inigo Neri Sereneri**·Margarida, Marquesa Taliani di Marchio**·Princesa Maria Antónia, Sra. Luis Pérez**·Arquiduquesa Assunta, Sra. Joseph Hopfinger**·Isabel, Condessa de Waldburg-Zeil**·Hedviges, Condessa de Stolberg-Stolberg**·Gertrudes, Condessa de Waldburg-Zeil-Trauchburg**·Arquiduquesa Maria Isabel**·Arquiduquesa Inês**·Arquiduquesa Margarida, Sra. Alexander Cech·Helena, Duquesa de Meclemburgo·Arquiduquesa Ana Teresa·Arquiduquesa Maria Kynga, Sra. Joachim Krist
16ª Geração
Arquiduquesa Adelaide·Carlota, Duquesa de Mecklenburg·Isabel, Princesa Henrique do Liechenstein·Isabel, Nobre Hubert von Braun**·Alice, Baronesa Vittorio Manno**·Maria Antonieta, Baronesa de Proff in Irnich**·Arquiduquesa Marie Cristina**·Arquiduquesa Walburga, Sra. Carlos Tasso**·Arquiduquesa Verena**·Arquiduquesa Catarina, Sra. Roland Huber**·Inês, Baronesa Peter de Fürstenberg**·Maria Ileana, Condessa Adam Kottulinski**·Alexandra, Baronesa Viktor de Baillou**·Maria Madalena, Baronesa de Holzhausen**·Arquiduquesa Isabel, Sra. Friedrich Sandhofer**·Inês, Princesa Carlos Alfredo do Liechenstein**·Arquiduquesa Maria Margarida**·Arquiduquesa Ludovica**·Arquiduquesa Alice**·Josefa, Condessa Clemens de Waldstein-Wartenberg**·Valéria, Margravina de Baden**·Alberta, Baronesa Alexander de Kottwitz-Erdödy**·Teresa, Princesa Rasso da Baviera**·Maria Imaculada, Condessa Reinhart de Hoensbroech**·Arquiduquesa Mónica, Sra. Charles de Rambures·Arquiduquesa Maria Cristina, Sra. Raymond van der Meide·Arquiduquesa Maria, Sra. Wilhelm de Witt·Margarida, Condessa Benedikt of Piatti
17ª Geração
Andreia, Condessa hereditária de Neipperg·Mônica, Duquesa de Santángelo·Micaela, Condessa Hubertus de Kageneck·Arquiduquesa Gabriela, Sra. Christian Meister·Walburga, Condessa Archibald Douglas·Maria Beatriz, Condessa Riprand de Arco-Zinneberg***·Isabel, Condessa Andrea Czarnocki-Lucheschi***·Maria del Pilar, Nobre Vollrad-Joachim von Poschinger·Kinga, Baroneas Wolfgang de Erffa·Arquiduquesa Marie Adelaide, Sra. Jaime Corcuerra·Arquiduquesa Viridis, Sra. Karl Dunning-Gribble·Arquiduquesa Alexandra, Sra. Héctor Riesle·Maria Constança, Princesa de Auersperg-Trautson·Maria Ana, Princesa Peter Galitzine·Catarina, Condessa Maximiliano Secco d'Aragona·Arquiduquesa Isabel, Sra. James Litchfield·Sofia, Princesa de Windisch-Grätz·Arquiduquesa Maria Cristina, Sra. Clemens Guggenberg·Arquiduquesa Maria Bernardete, Sra. Rupert Wolff**·Arquiduquesa Catarina, Sra. Niall Brooks**·Arquiduquesa Alicia**·Arquiduquesa Maria Cristina**·Arquiduquesa Margarida, Sra. Andreas Baumgartner**·Arquiduquesa Maria Valéria, Sra. Martin Josef Wagner**·Arquiduquesa Hedviges**·Arquiduquesa Verónica**·Arquiduquesa Joana·Arquiduquesa Isabel·Arquiduquesa Celina·Arquiduquesa Maria Floriana·Arquiduquesa Sofia·Arquiduquesa Ana Carolina·Arquiduquesa Teresa·Arquiduquesa Sofia·Arquiduquesa Ladislaya
18ª Geração
Arquiduquesa Leonor·Arquiduquesa Glória·Arquiduquesa Sofia·Arquiduquesa Hilda·Arquiduquesa Maria Laura***·Arquiduquesa Luísa Maria***·Arquiduquesa Letícia Maria***·Arquiduquesa Sofia·Arquiduquesa Maria Teresa·Arquiduquesa Margarida·Arquiduquesa Priscilla·Arquiduquesa Maria das Neves·Maria Cristina, Condessa Rodolphe de Limburg-Stirum·Arquiduquesa Gabriela·Arquiduquesa Antónia·Arquiduquesa Isabel·Arquiduquesa Carlota·Arquiduquesa Paulina·Arquiduquesa Lara·Arquiduquesa Tatiana**·Arquiduquesa Anabela**·Arquiduquesa Tara**
19ª Geração
Arquiduquesa Zita·Arquiduquesa Anežka
também infanta de Espanha *também princesa da Toscânia **também princesa da Modena