Apesar de ter sido baptizada de Gisella (com dois L), ela sempre escreveu o seu nome apenas com um. Recebeu o nome em honra de um dos seus antepassados Habsburgo. Tal como a sua irmã mais velha e o seu irmão, Gisela foi criada pela sua avó paterna, a Arquiduquesa Sofia da Áustria. Era muito chegada ao seu irmão mais novo, o Príncipe-herdeiro Rudolfo, cujo suicídio aparente foi um duro golpe. O seu pai tinha o costume de coleccionar objectos pessoais da família, como o primeiro par de sapatos usados por cada um dos seus filhos. Entre estes objectos encontrava-se um poema escrito para ele por Gisela quando ela era uma criança no Natal e era o que ele mais estimava na sua colecção. A Arquiquesa Gisela também começou a pintar nos seus últimos anos.
No dia 20 de Abril de 1873, Gisela casou-se com o Príncipe Leopoldo da Baviera, um filho do Príncipe Regente Leopoldo da Baviera e da Arquiduquesa Augusta de Áustria-Toscana, em Viena.[1][2] Os dois eram primos em segundo-grau. Numa carta escrita à sua mãe em 1872, o Imperador Francisco José queria que este casamento se realizasse uma vez que havia poucos príncipes católicos disponíveis na altura e ele queria ter a certeza que dava a sua filha (a quem chamou "a nossa querida menina" durante a cerimónia de casamento) com confiança. Um ano depois ela deu à luz sua primeira filha, Isabel Maria, e teve quatro filhos ao todo. Foi bem recebida em Munique pela família do marido e viveu no Palácio Leopoldo em Schwabing onde a rua atrás do palácio recebeu o nome de Giselastraße em sua honra em 1873.
Ela envolveu-se profundamente em várias questões políticas e sociais e criou instituições de caridade para ajudar os pobres, cegos e surdos onde ela mesma participava activamente. Durante a Primeira Guerra Mundial dirigiu um hospital militar no seu palácio enquanto o seu marido combatia na frente oriental. Quando a Revolução Alemã rebentou em 1918, todos os membros da sua família fugiram da cidade, mas Gisela ficou e participou nas eleições de 1919 para a Assembleia Nacional de Weimar onde todas as mulheres acima dos 20 anos puderam votar pela primeira vez.
Era tão adorada que era conhecida como o Bom Anjo de Viena e, sem surpresas, tornou-se patrocinadora de um grande número de instituições como o Giselabahn, um comboio que fazia a viagem de Salzburgo a Tirol, do Gisela, um barco a vapor ainda activo e da Academia Gisela em Munique.
Gisela e o marido celebraram as bodas de ouro do seu casamento em 1923. O seu marido morreu em 1930 e Gisela viveu apenas por mais dois anos, morrendo aos 76 anos em Munique, no dia 27 de Julho de 1932. Está enterrada junto do Príncipe Leopoldo em São Michaelskirche, em Munique.
Entre os seus familiares mais famosos encontra-se o seu tio, o Imperador Maxilimiliano I do México que era irmão do seu pai.
Maria Antónia, Eleitora da Baviera·Arquiduquesa Maria Ana·Arquiduquesa Cristina·Maria Isabel da Áustria (1680)·Arquiduquesa Maria Isabel·Maria Ana, Rainha de Portugal·Arquiduquesa Maria Teresa da Áustria (1684)·Arquiduquesa Maria Teresa·Arquiduquesa Maria Josefa·Maria Madalena de Áustria·Arquiduquesa Maria Madalena·Arquiduquesa Maria Margarida
Isabel Maria, Princesa de Windisch-Graetz·Helena, Duquesa Filipe de Württemberg**·Rosa, Duquesa Württemberg**·Arquiduquesa Dolores**·Maria Imaculada, Nobile Inigo Neri Sereneri**·Margarida, Marquesa Taliani di Marchio**·Princesa Maria Antónia, Sra. Luis Pérez**·Arquiduquesa Assunta, Sra. Joseph Hopfinger**·Isabel, Condessa de Waldburg-Zeil**·Hedviges, Condessa de Stolberg-Stolberg**·Gertrudes, Condessa de Waldburg-Zeil-Trauchburg**·Arquiduquesa Maria Isabel**·Arquiduquesa Inês**·Arquiduquesa Margarida, Sra. Alexander Cech·Helena, Duquesa de Meclemburgo·Arquiduquesa Ana Teresa·Arquiduquesa Maria Kynga, Sra. Joachim Krist
16ª Geração
Arquiduquesa Adelaide·Carlota, Duquesa de Mecklenburg·Isabel, Princesa Henrique do Liechenstein·Isabel, Nobre Hubert von Braun**·Alice, Baronesa Vittorio Manno**·Maria Antonieta, Baronesa de Proff in Irnich**·Arquiduquesa Marie Cristina**·Arquiduquesa Walburga, Sra. Carlos Tasso**·Arquiduquesa Verena**·Arquiduquesa Catarina, Sra. Roland Huber**·Inês, Baronesa Peter de Fürstenberg**·Maria Ileana, Condessa Adam Kottulinski**·Alexandra, Baronesa Viktor de Baillou**·Maria Madalena, Baronesa de Holzhausen**·Arquiduquesa Isabel, Sra. Friedrich Sandhofer**·Inês, Princesa Carlos Alfredo do Liechenstein**·Arquiduquesa Maria Margarida**·Arquiduquesa Ludovica**·Arquiduquesa Alice**·Josefa, Condessa Clemens de Waldstein-Wartenberg**·Valéria, Margravina de Baden**·Alberta, Baronesa Alexander de Kottwitz-Erdödy**·Teresa, Princesa Rasso da Baviera**·Maria Imaculada, Condessa Reinhart de Hoensbroech**·Arquiduquesa Mónica, Sra. Charles de Rambures·Arquiduquesa Maria Cristina, Sra. Raymond van der Meide·Arquiduquesa Maria, Sra. Wilhelm de Witt·Margarida, Condessa Benedikt of Piatti
17ª Geração
Andreia, Condessa hereditária de Neipperg·Mônica, Duquesa de Santángelo·Micaela, Condessa Hubertus de Kageneck·Arquiduquesa Gabriela, Sra. Christian Meister·Walburga, Condessa Archibald Douglas·Maria Beatriz, Condessa Riprand de Arco-Zinneberg***·Isabel, Condessa Andrea Czarnocki-Lucheschi***·Maria del Pilar, Nobre Vollrad-Joachim von Poschinger·Kinga, Baroneas Wolfgang de Erffa·Arquiduquesa Marie Adelaide, Sra. Jaime Corcuerra·Arquiduquesa Viridis, Sra. Karl Dunning-Gribble·Arquiduquesa Alexandra, Sra. Héctor Riesle·Maria Constança, Princesa de Auersperg-Trautson·Maria Ana, Princesa Peter Galitzine·Catarina, Condessa Maximiliano Secco d'Aragona·Arquiduquesa Isabel, Sra. James Litchfield·Sofia, Princesa de Windisch-Grätz·Arquiduquesa Maria Cristina, Sra. Clemens Guggenberg·Arquiduquesa Maria Bernardete, Sra. Rupert Wolff**·Arquiduquesa Catarina, Sra. Niall Brooks**·Arquiduquesa Alicia**·Arquiduquesa Maria Cristina**·Arquiduquesa Margarida, Sra. Andreas Baumgartner**·Arquiduquesa Maria Valéria, Sra. Martin Josef Wagner**·Arquiduquesa Hedviges**·Arquiduquesa Verónica**·Arquiduquesa Joana·Arquiduquesa Isabel·Arquiduquesa Celina·Arquiduquesa Maria Floriana·Arquiduquesa Sofia·Arquiduquesa Ana Carolina·Arquiduquesa Teresa·Arquiduquesa Sofia·Arquiduquesa Ladislaya
18ª Geração
Arquiduquesa Leonor·Arquiduquesa Glória·Arquiduquesa Sofia·Arquiduquesa Hilda·Arquiduquesa Maria Laura***·Arquiduquesa Luísa Maria***·Arquiduquesa Letícia Maria***·Arquiduquesa Sofia·Arquiduquesa Maria Teresa·Arquiduquesa Margarida·Arquiduquesa Priscilla·Arquiduquesa Maria das Neves·Maria Cristina, Condessa Rodolphe de Limburg-Stirum·Arquiduquesa Gabriela·Arquiduquesa Antónia·Arquiduquesa Isabel·Arquiduquesa Carlota·Arquiduquesa Paulina·Arquiduquesa Lara·Arquiduquesa Tatiana**·Arquiduquesa Anabela**·Arquiduquesa Tara**
19ª Geração
Arquiduquesa Zita·Arquiduquesa Anežka
também infanta de Espanha *também princesa da Toscânia **também princesa da Modena
Elisabeth Douglas • Katrin Beatrix Wiegand • Beatrice de Lodron-Laterano and Castelromano • Gudilia de Plettenberg • Ursula Möhlenkamp • Marion Malkowsky • Sandra Burghardt