O prédio ocupado pelo AquaRio possui um total de cinco andares e 28 tanques com variados tipos de peixes. Nos tanques, estão armazenados cerca de 4,5 milhões de litros de água salgada, além de oito mil animais de 350 espécies diferentes.[4] O prédio antes pertencia à Companhia Brasileira de Armazenamento (Cibrazem), hoje Companhia Nacional de Abastecimento (CONAB).[3]
Além da visita aos tanques, o AquaRio possibilita ao visitante a realização das seguintes atividades adicionais, sujeitas a cobrança à parte: o Dormindo no AquaRio, onde o visitante pode passar uma noite no túnel que passa no meio do Grande Tanque Oceânico;[6] o Mergulho do Tanque Oceânico, onde o visitante pode mergulhar em um dos tanques;[7] o Peixe Virtual, onde o visitante pode criar um amigo virtual no início do passeio e interagir com ele ao longo do circuito;[8] e a Visita aos Bastidores, onde o visitante pode ver de perto os equipamentos que tratam a água dos recintos, o trabalho dos biólogos e o modo de realização da alimentação dos peixes.[9]
O visitante do AquaRio também pode usufruir das seguintes atrações: do Aquário Virtual, um aquário digital com peixes criados pelos visitantes;[10] do Museu da Ciência, composto pela Estação do Plâncton e pela Exposição de Conchas;[11] e do Museu do Surf, um espaço dedicado ao surf elaborado pelo surfista Rico de Souza.[12] Como parte de sua estrutura, o AquaRio possui um café, um centro de pesquisa científica, um estacionamento e uma loja de souvenires, incluindo alguns quiosques.
Teto solar
Em 31 de maio de 2016, foi inaugurado no AquaRio o maior telhado solar instalado em áreas urbanas do Brasil. Composto por cerca de dois mil painéis solares instalados em uma área de seis mil metros quadrados, o telhado solar irá gerar cerca de 77 mil quilowatts de energia por mês, equivalente ao consumo mensal de 500 residências brasileiras. O telhado reduz em até 30 por cento o gasto de energia elétrica consumida pelo aquário.[13]
Visitação
Em 25 de julho de 2022, o AquaRio atingiu a marca de cinco milhões de visitantes e presenteou a família que atingiu esta marca com um passaporte de sócio vitalício e uma visita ao backstage.[2]
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Foi muito legal porque eu fui pego de surpresa, estava entrando com a minha pipoca e do nada jogaram vários confetes com buzinas. Eu e minha família nos sentimos privilegiados, acho que demos só um pouco de sorte, não só por ganhar vários brindes, mas também por poder visitar o AquaRio sempre que eu quiser a partir de agora
”
— Enzo Viana, 10 anos, agora sócio vitalício do AquaRio, [2]