Po przyjęciu sakry biskupiej w 1995 objął władzę w diecezji lubelsko-podlaskiej, w latach 1997–2007 pełnił funkcję ordynariusza diecezji śląsko-łódzkiej. 20 lipca 2007 Kapituła Zgromadzenia Mariawitów wybrała bp Michała Jabłońskiego zwierzchnikiem Kościoła Starokatolickiego Mariawitów, zastąpił on tym samym dotychczasowego bp naczelnego Zdzisława Jaworskiego. Decyzją II sesji Kapituły Generalnej Kościoła Starokatolickiego Mariawitów z 22 sierpnia 2011 pełni dodatkowo funkcję biskupa diecezji lubelsko–podlaskiej. 31 sierpnia 2015, zgodnie z uchwałą II sesji Kapituły Generalnej, zastąpiony na stanowisku biskupa naczelnego (zwierzchnika Kościoła) przez biskupa Marka Marię Karola Babiego, nadal natomiast pozostał ordynariuszem diecezji lubelsko-podlaskiej.
Zgodnie z decyzją Rady Kościoła z dnia 14 września 2015 bp M. Ludwik Jabłoński rezydował w Płocku przy Świątyni Miłosierdzia i Miłości, pełniąc jednocześnie funkcję biskupa diecezji lubelsko-podlaskiej. Została mu powierzona opieka nad klerykami oraz sprawy bieżące parafii płockiej i klasztoru. Formalnie jednak proboszczem parafii w Płocku był biskup naczelny Karol Babi.
11 lutego 2023 roku Kapituła Generalna Kościoła Starokatolickiego Mariawitów powierzyła mu pełnienie obowiązków Biskupa Naczelnego po odwołaniu z tej funkcji bp. M. Karola Babiego, które zakończył w momencie wyboru nowego Biskupa Naczelnego, którym został Jarosław Maria Jan Opala[1][2].
