Hrabstwo Hettinger zostało utworzone podczas reformy terytorialnej w roku 1883. Jest nazwane na cześć Mathiasa K. Hettingera, prominentnego mieszkańca Freeport w stanie Illinois. Organy samorządowe hrabstwa zostały utworzone 19 kwietnia1907 roku. Siedzibą hrabstwa od początku było Mott.
Geografia
Hrabstwo Hettinger zajmuje powierzchnię całkowitą 2 936,27 km², z czego 2 932,51 km² to powierzchnia lądowa, a 3,76 km² (0,1%) to powierzchnia wodna.