Dette er en liste over øyer i Indonesia. I henhold til Det koordinerende ministeriet for maritime affærer består Indonesia av fem store øyer og 17 503 mindre øyer.[1] Av disse er omkring 6 000 bebodde. 16 056 øyer har navn som var godkjent av FNs ekspertgruppe for geografiske navn per juli 2017.[2]
Øyene danner en kjede mellom Asia og Australia.[3] Indonesia er det landet i verden med størst antall øyer, og denne listen inneholder derfor kun de største og viktigste av dem.
