Het seizoen 2000/01 van de BelgischeTweede klasse ging van start in de zomer van 2000 en de reguliere competitie eindigde in mei 2001. Van 12 mei tot 31 mei werd nog de eindronde gespeeld. KFC Lommel SK, dat net gedegradeerd was, werd kampioen.
Deinze verloor in de eindronde waardoor het normaal gezien moest degraderen. KV Turnhout kreeg echter geen licentie en zakte naar derde klasse waardoor Deinze in tweede klasse mocht blijven.
Het team dat 16de eindigde, KMSK Deinze, speelde een eindronde met een aantal derdeklassers en ging daar van start in de tweede ronde van die eindronde.
De officiële benamingen van deze competitie luidden achtereenvolgens Bevordering (van 1909 tot 1926), Eerste Afdeling (van 1926 tot 1952), Tweede Klasse (van 1952 tot 2016).