Duncan II, Gaelisch: Donnchadh mac Mhaoil Chaluim (?, vóór 1060 - ?, 12 november 1094), was koning van Schotland van mei 1094 tot en met 12 november 1094.
In mei 1094 wist hij met de hulp van Engelse en Franse troepen zijn oom Donald III van de troon te stoten. Op 12 november van hetzelfde jaar werd hij vermoord door zijn halfbroer Edmund (zoon van Malcolm III en diens tweede vrouw Margaretha) en heroverde Donald III de Schotse troon.
Duncan II werd begraven in Dunfermline Abbey.