Buvusio dvaro archyvuose yra 1790 m. gruodžio 5 d. raštas, kuriame kalbama apie parapinės mokyklos fundaciją, skiriant bakalaurui (mokytojui) vieną valaką žemės. Ši data ir laikytina mokyklos įkūrimo pradžia. Tolesnis mokyklos likimas buvo sunkus ir vingiuotas. Lenkijos-Lietuvos valstybės dalybos skaudžiai atsiliepė kraštui. Rusų kariuomenė jį labai nusiaubė. 1808 m. Vilniaus universiteto atstovas, atvykęs vizituoti Adutiškio parapinės mokyklos, jos nerado. Veikė tik žydų mokykla.
Mokyklos reikalais susirūpinta tik 1822 m. Darbai baigti 1826 m. Po dvejų metų mokykloje mokėsi tik 6 vaikai, tačiau vėliau mokykla išsiplėtė, sustiprėjo. 1840 m. ją lankė daugiau kaip 60 vaikų, tarp kurių – net kelios mergaitės. Adutiškio parapinė mokykla buvo dviklasė. Joje buvo mokomas katekizmas, geografija, aritmetika, lotynų ir lenkų kalbų gramatika, gamtos mokslas. Po 1863 m. sukilimo pradinės mokyklos buvo uždarytos, jų vietoje steigiamos vadinamos liaudies mokyklos, kuriose buvo dėstoma rusų kalba. Mokykloje buvo reikalaujama kalbėti tik rusiškai. Lietuviškai ar lenkiškai skaityti vaikai pramokdavo iš apsišvietusių žmonių, kurie daraktoriavo kaimuose. Tik 1915 m. carinė vyriausybė leido Adutiškyje įkurti lietuvišką pradinę mokyklą, kurioje mokėsi apie 100 mokinių.
1920 m. lenkams okupavus Vilniaus kraštą, Adutiškis atsidūrė Lenkijos sudėtyje. 1924 m. mokykla buvo perorganizuota į lenkų septynmetę. 1939 m. Stalino sprendimu dalis Švenčionių rajono ir Adutiškis atiteko Baltarusijai, mokykla perorganizuota į lietuvių-rusų-baltarusų septynmetę. Adutiškiečiai rinko parašus, kad kraštas būtų grąžintas Lietuvai. Tik 1940 m. vasarą šis prašymas buvo patenkintas. 1942–1943 m. veikė lietuviška progimnazija, po karo tapusi vidurine mokykla. 2012 m. rugsėjo 1 d. prie mokyklos prijungta Svirkų pagrindinė mokykla. 2020 m. Adutiškio pagrindinė mokykla prijungta prie Švenčionių Z. Žemaičio gimnazijos.[3]